More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3602 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 
417 aa  839    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  74.45 
 
 
421 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  71.08 
 
 
419 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  69.86 
 
 
421 aa  591  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  57.35 
 
 
416 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  55.85 
 
 
423 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.16 
 
 
413 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.66 
 
 
419 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  50.48 
 
 
413 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.68 
 
 
413 aa  362  6e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  45.58 
 
 
418 aa  358  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  43.68 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.43 
 
 
423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  44.39 
 
 
420 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.33 
 
 
418 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  39.86 
 
 
418 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  39.86 
 
 
418 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.04 
 
 
418 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  45.73 
 
 
417 aa  341  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  41.53 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.03 
 
 
431 aa  339  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  42.41 
 
 
416 aa  339  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  43.61 
 
 
418 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  47.41 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.02 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  43.06 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  41.63 
 
 
418 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.72 
 
 
420 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.78 
 
 
418 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.58 
 
 
417 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.82 
 
 
417 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.02 
 
 
421 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.82 
 
 
431 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  40.9 
 
 
421 aa  330  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.62 
 
 
418 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  43.58 
 
 
416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  45.06 
 
 
418 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  39.86 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.43 
 
 
419 aa  325  7e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.89 
 
 
417 aa  323  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.72 
 
 
424 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.65 
 
 
417 aa  322  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.38 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  44.87 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.83 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  42.65 
 
 
417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.52 
 
 
428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.62 
 
 
424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 
424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.77 
 
 
418 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  44.28 
 
 
410 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.27 
 
 
416 aa  319  7e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 
424 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.39 
 
 
420 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.28 
 
 
415 aa  317  3e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.35 
 
 
429 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.77 
 
 
392 aa  316  5e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  41.69 
 
 
419 aa  316  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.57 
 
 
424 aa  315  8e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.07 
 
 
417 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.75 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.2 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.57 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.29 
 
 
424 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.57 
 
 
419 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.97 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.97 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  39.66 
 
 
418 aa  305  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  40.96 
 
 
415 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  41.93 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.55 
 
 
419 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.62 
 
 
415 aa  301  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.1 
 
 
419 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.19 
 
 
415 aa  300  5e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.27 
 
 
420 aa  299  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  39.71 
 
 
422 aa  298  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.77 
 
 
421 aa  297  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.37 
 
 
431 aa  296  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.06 
 
 
419 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.1 
 
 
421 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.61 
 
 
419 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  43.17 
 
 
404 aa  292  8e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  42.17 
 
 
403 aa  289  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.79 
 
 
423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1364  homoaconitate hydratase family protein  38.77 
 
 
426 aa  285  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.66 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.02 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.93 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  42.41 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.52 
 
 
435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.65 
 
 
418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.04 
 
 
420 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.09 
 
 
422 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2057  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.48 
 
 
415 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376954  normal  0.299837 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.23 
 
 
421 aa  280  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  39.07 
 
 
432 aa  279  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  40.81 
 
 
424 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  39.25 
 
 
398 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.9 
 
 
426 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>