More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0634 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 403 aa  802    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  68.66 
 
 		 403 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  70.3 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  63.37 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  62.53 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.24 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.53 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  54.19 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  50.72 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  46.54 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.58 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  45.58 
 
 		 418 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  46.52 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  44.76 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  45.93 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.84 
 
 		 418 aa  342  9e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.07 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.91 
 
 		 425 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  43.34 
 
 		 429 aa  335  5.999999999999999e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.1 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  45.26 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.25 
 
 		 418 aa  332  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.69 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  44.5 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.1 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.15 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  41.45 
 
 		 420 aa  328  8e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.76 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.87 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.63 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.63 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.25 
 
 		 415 aa  324  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.17 
 
 		 417 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.63 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  48.67 
 
 		 413 aa  322  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.93 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  47.97 
 
 		 418 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  42.37 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  44.42 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  45.3 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.2 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  44.07 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.68 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  41.12 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  44.58 
 
 		 416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.11 
 
 		 419 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  47.35 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.5 
 
 		 392 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.43 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.2 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  46.02 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.62 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.77 
 
 		 418 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.9 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.56 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.96 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  44.19 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  46.93 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.21 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  38.07 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.53 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.34 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.34 
 
 		 416 aa  299  7e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.89 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.61 
 
 		 427 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.5 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.76 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.58 
 
 		 419 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.1 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.11 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.62 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.05 
 
 		 416 aa  292  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.91 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.31 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.27 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.29 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.24 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  42 
 
 		 437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.72 
 
 		 420 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  41.46 
 
 		 410 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.83 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.98 
 
 		 419 aa  288  8e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.81 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.99 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.85 
 
 		 419 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3159  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.96 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000477252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.17 
 
 		 417 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.9 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  41.12 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.21 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.23 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.75 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.75 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.09 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.14 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.25 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.2 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.2 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.65 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>