More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2143 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 
406 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  70.3 
 
 
403 aa  547  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  64.85 
 
 
403 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  61.08 
 
 
404 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  60.15 
 
 
417 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.97 
 
 
413 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50 
 
 
413 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  51.44 
 
 
382 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  47.46 
 
 
418 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  44.98 
 
 
418 aa  348  8e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.44 
 
 
418 aa  347  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  44.74 
 
 
418 aa  345  8e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  44.26 
 
 
418 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.89 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.18 
 
 
423 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  44.53 
 
 
418 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.41 
 
 
417 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  43.06 
 
 
418 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.13 
 
 
425 aa  329  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  44 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.07 
 
 
418 aa  327  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.83 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.69 
 
 
431 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  42.65 
 
 
416 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.24 
 
 
431 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  40.05 
 
 
418 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  41.26 
 
 
419 aa  322  7e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  42.51 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  40.58 
 
 
429 aa  319  6e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.62 
 
 
424 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  43.27 
 
 
418 aa  318  7.999999999999999e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.19 
 
 
415 aa  318  9e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.06 
 
 
417 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.04 
 
 
424 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.06 
 
 
417 aa  316  4e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  41.65 
 
 
416 aa  315  9e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.8 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.86 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  44.5 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  43.13 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.93 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  44.39 
 
 
416 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  43.7 
 
 
418 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  43.99 
 
 
413 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  43.51 
 
 
417 aa  310  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  41.85 
 
 
417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.87 
 
 
424 aa  309  6.999999999999999e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.41 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.97 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.67 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.7 
 
 
416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.52 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.48 
 
 
424 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.77 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.57 
 
 
419 aa  302  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  39.04 
 
 
420 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.7 
 
 
416 aa  302  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.53 
 
 
418 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.29 
 
 
428 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  44.32 
 
 
423 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  37.59 
 
 
418 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.38 
 
 
429 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.62 
 
 
419 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.57 
 
 
418 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.81 
 
 
419 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.05 
 
 
419 aa  293  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.86 
 
 
420 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.25 
 
 
419 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.45 
 
 
420 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.1 
 
 
420 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.95 
 
 
418 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.87 
 
 
418 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  39.14 
 
 
437 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.7 
 
 
419 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.24 
 
 
419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.24 
 
 
419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.37 
 
 
421 aa  286  5e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.95 
 
 
423 aa  286  5e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.19 
 
 
421 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.42 
 
 
419 aa  285  8e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  40.82 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  40.87 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.61 
 
 
420 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.66 
 
 
421 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.42 
 
 
431 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.46 
 
 
420 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.1 
 
 
419 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.37 
 
 
419 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.57 
 
 
415 aa  277  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.06 
 
 
427 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.25 
 
 
421 aa  275  9e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.16 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.6 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.6 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  36.97 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.95 
 
 
421 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.13 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  39 
 
 
410 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.23 
 
 
421 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.56 
 
 
422 aa  262  8.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>