More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0583 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  74.05 
 
 		 423 aa  644    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 422 aa  862    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.43 
 
 		 419 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.64 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.88 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  65.23 
 
 		 418 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.75 
 
 		 419 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.65 
 
 		 415 aa  558  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.51 
 
 		 421 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.8 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.75 
 
 		 420 aa  552  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.79 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.23 
 
 		 419 aa  541  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.38 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.44 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.35 
 
 		 421 aa  532  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.07 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.86 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  61.15 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.71 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  58.99 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.47 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  58.19 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  57.96 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.73 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  57.55 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.46 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.01 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.49 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.81 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.93 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.8 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.98 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  51.56 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.78 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.98 
 
 		 421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.28 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.94 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.74 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  47.85 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  48.32 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  49.16 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  46.28 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  48.45 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  46.06 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.2 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.14 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.39 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  46.92 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  47.58 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  43.65 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.82 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.63 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.63 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.39 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  46.27 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  46.34 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.95 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.95 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  43.1 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  45.82 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.75 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.41 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.54 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  44.39 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.54 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.05 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  44.02 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  45.56 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.28 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.72 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.32 
 
 		 418 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  44.65 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.08 
 
 		 418 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.53 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  44.65 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.66 
 
 		 427 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.66 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  43.51 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.44 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  42.92 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  44.47 
 
 		 417 aa  342  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  41.72 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3159  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.1 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000477252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  41.96 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  43.75 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.3 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.54 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  40.87 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.3 
 
 		 417 aa  328  8e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  40.33 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  40.56 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  40.33 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.13 
 
 		 413 aa  326  6e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  43.16 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  41.49 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  41.03 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  43.88 
 
 		 417 aa  322  8e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>