More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3302 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 
421 aa  855    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  72.62 
 
 
421 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  72.32 
 
 
419 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  74.45 
 
 
417 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  56.63 
 
 
416 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  56.39 
 
 
423 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.85 
 
 
419 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.13 
 
 
413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  44.6 
 
 
418 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  46.9 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.13 
 
 
420 aa  345  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.95 
 
 
415 aa  343  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  43.47 
 
 
420 aa  341  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  41.88 
 
 
418 aa  342  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  43.06 
 
 
418 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.72 
 
 
419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  39.95 
 
 
419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  42.14 
 
 
418 aa  335  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.4 
 
 
418 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.28 
 
 
431 aa  332  8e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.16 
 
 
418 aa  331  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  39.76 
 
 
418 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.67 
 
 
424 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40 
 
 
424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  45.18 
 
 
418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.91 
 
 
424 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.76 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.71 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  40.81 
 
 
416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.67 
 
 
420 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  39.29 
 
 
418 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  42.35 
 
 
416 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  40.85 
 
 
429 aa  325  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.67 
 
 
418 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  39.06 
 
 
418 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.15 
 
 
423 aa  323  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  46.37 
 
 
382 aa  323  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.44 
 
 
424 aa  322  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.24 
 
 
420 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.25 
 
 
416 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.61 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.9 
 
 
418 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.49 
 
 
419 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.49 
 
 
419 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.97 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.01 
 
 
417 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.48 
 
 
424 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.71 
 
 
419 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.58 
 
 
425 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.25 
 
 
416 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.73 
 
 
424 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.68 
 
 
418 aa  315  9e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.55 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.28 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  41.53 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  43.1 
 
 
417 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.15 
 
 
417 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.72 
 
 
417 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.52 
 
 
420 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  40.81 
 
 
417 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  42.27 
 
 
410 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.78 
 
 
431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.15 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  37.83 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  41.94 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  41.67 
 
 
417 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.35 
 
 
419 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.43 
 
 
420 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.48 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.09 
 
 
421 aa  302  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.77 
 
 
419 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 
435 aa  299  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.33 
 
 
419 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 
419 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.81 
 
 
419 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.53 
 
 
431 aa  296  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1364  homoaconitate hydratase family protein  39.58 
 
 
426 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.21 
 
 
426 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.04 
 
 
422 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.38 
 
 
418 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.24 
 
 
428 aa  292  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  36.99 
 
 
418 aa  292  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.91 
 
 
423 aa  291  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  42.86 
 
 
403 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.98 
 
 
427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.28 
 
 
427 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  39.53 
 
 
422 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.73 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.67 
 
 
418 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.24 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  40.71 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  40.48 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.73 
 
 
427 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.46 
 
 
421 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  39.17 
 
 
432 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  41.81 
 
 
403 aa  279  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.12 
 
 
427 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.12 
 
 
427 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.5 
 
 
427 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>