More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4843 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 435 aa  881    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  65.56 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.62 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.35 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.74 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  41.71 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  38.42 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  40.32 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  39.38 
 
 		 418 aa  325  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.95 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  38.19 
 
 		 418 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  39.19 
 
 		 418 aa  322  9.000000000000001e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.23 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.66 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  36.64 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.96 
 
 		 421 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  37.79 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.65 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  37.41 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.32 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.17 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  35.57 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.94 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.79 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  35.88 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  36.95 
 
 		 431 aa  305  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.47 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.73 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  39.49 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.24 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  37.41 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.01 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  36.24 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.68 
 
 		 417 aa  299  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.01 
 
 		 413 aa  298  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.26 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.47 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.97 
 
 		 418 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  36.95 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.97 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  36.43 
 
 		 418 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.68 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  36.67 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  35.39 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  35.1 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.78 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  35.36 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.32 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.84 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.2 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.52 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  38.57 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  38.48 
 
 		 437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.69 
 
 		 416 aa  289  7e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  38.76 
 
 		 413 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.12 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.52 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  36.41 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.93 
 
 		 421 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.22 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  35 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.45 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.17 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.21 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.26 
 
 		 420 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.31 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  38.3 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.12 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.23 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.52 
 
 		 419 aa  279  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.51 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.58 
 
 		 418 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.69 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  32.7 
 
 		 418 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.65 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  35.82 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.68 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.67 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.67 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.88 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.28 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  36.84 
 
 		 417 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.57 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.45 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  38.13 
 
 		 419 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.04 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.93 
 
 		 420 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.73 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  35.58 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.02 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  38.76 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.19 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.83 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.73 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.06 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.52 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.2 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>