More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1910 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 
428 aa  865    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  86.25 
 
 
429 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.42 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  61.16 
 
 
440 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  60.94 
 
 
434 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  44.11 
 
 
432 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  42.36 
 
 
431 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  41.53 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.57 
 
 
424 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  40.42 
 
 
432 aa  329  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.39 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.39 
 
 
424 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  37.41 
 
 
435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  39.62 
 
 
418 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.09 
 
 
424 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  39.81 
 
 
431 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  42.14 
 
 
418 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  39.49 
 
 
432 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.62 
 
 
424 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.9 
 
 
418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  39.45 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  38.66 
 
 
418 aa  319  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  40.8 
 
 
418 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  40.09 
 
 
431 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  37.91 
 
 
421 aa  316  5e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.45 
 
 
413 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  38.43 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  38.55 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.9 
 
 
431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  38.42 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  40.33 
 
 
416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.71 
 
 
424 aa  312  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.59 
 
 
425 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.65 
 
 
424 aa  312  9e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.34 
 
 
431 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  37.95 
 
 
419 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.62 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.76 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  39.11 
 
 
429 aa  310  4e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.71 
 
 
418 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.71 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.99 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  41.67 
 
 
410 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.95 
 
 
420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.57 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.97 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.66 
 
 
420 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.14 
 
 
421 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  42.96 
 
 
418 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  37.86 
 
 
418 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  40.38 
 
 
413 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.57 
 
 
421 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.14 
 
 
421 aa  299  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.1 
 
 
417 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.62 
 
 
418 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.1 
 
 
417 aa  296  6e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.53 
 
 
419 aa  296  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.1 
 
 
415 aa  296  6e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.47 
 
 
419 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  39.1 
 
 
420 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.23 
 
 
418 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.04 
 
 
431 aa  292  6e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.93 
 
 
419 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  37.47 
 
 
422 aa  291  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.32 
 
 
429 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.25 
 
 
418 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  39.76 
 
 
437 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.62 
 
 
420 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.36 
 
 
419 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.36 
 
 
419 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.28 
 
 
422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.45 
 
 
416 aa  286  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.21 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.84 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.85 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.21 
 
 
427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.78 
 
 
421 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.24 
 
 
417 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  37.53 
 
 
417 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.21 
 
 
417 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.94 
 
 
421 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  41.86 
 
 
382 aa  280  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.31 
 
 
427 aa  279  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.77 
 
 
417 aa  279  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.43 
 
 
421 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.22 
 
 
427 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.17 
 
 
419 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  34.93 
 
 
418 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.57 
 
 
427 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.28 
 
 
421 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.17 
 
 
419 aa  275  8e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.62 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.8 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.08 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.84 
 
 
427 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.12 
 
 
426 aa  273  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.32 
 
 
427 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.32 
 
 
427 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.82 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>