More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0738 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  83.29 
 
 		 431 aa  769    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  84.22 
 
 		 431 aa  775    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  85.85 
 
 		 432 aa  789    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  83.99 
 
 		 431 aa  770    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  86.54 
 
 		 431 aa  794    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  85.85 
 
 		 431 aa  792    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  68.91 
 
 		 432 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  100 
 
 		 432 aa  901    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  60.59 
 
 		 439 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  59.16 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  43.02 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.42 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.52 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.84 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.73 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.68 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.23 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  40.65 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.33 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.4 
 
 		 424 aa  346  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.78 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.55 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.01 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.97 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.29 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.1 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.36 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.36 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.55 
 
 		 424 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.6 
 
 		 419 aa  336  5e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  41.16 
 
 		 420 aa  332  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.23 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.01 
 
 		 421 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.93 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.71 
 
 		 421 aa  325  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.95 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  41.53 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.55 
 
 		 431 aa  322  9.000000000000001e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.23 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.66 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.32 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  41.57 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.51 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.33 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.72 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.64 
 
 		 421 aa  316  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  39.44 
 
 		 416 aa  316  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.49 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.33 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.79 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.28 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  38.75 
 
 		 419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  42.63 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.77 
 
 		 418 aa  305  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.14 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  41.44 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.49 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.32 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  41.25 
 
 		 382 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  40.23 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  42.96 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.23 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  37.96 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.37 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.14 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.25 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.03 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  38.11 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.03 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.25 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  36.87 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.77 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  40.74 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.87 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  37.59 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.9 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  39.07 
 
 		 413 aa  292  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  37.59 
 
 		 418 aa  292  9e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  37.56 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.12 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.99 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.14 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  38.94 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.69 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.87 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  38.31 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.88 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.26 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.44 
 
 		 418 aa  276  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.81 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.22 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  36.72 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.59 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  36.18 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.19 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.02 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.79 
 
 		 417 aa  265  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.14 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>