More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1900 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  84.45 
 
 		 431 aa  771    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 431 aa  897    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  88.86 
 
 		 431 aa  811    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  68.68 
 
 		 432 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  83.76 
 
 		 431 aa  775    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  81.9 
 
 		 432 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  84.22 
 
 		 432 aa  775    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  85.15 
 
 		 431 aa  786    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  60.09 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  60.82 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  43.16 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.35 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.52 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.7 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.88 
 
 		 418 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  41.8 
 
 		 418 aa  349  7e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.12 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.01 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 		 424 aa  346  6e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.79 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.88 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.11 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.98 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.89 
 
 		 420 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.52 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.52 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  41.86 
 
 		 420 aa  338  8e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.79 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.66 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.49 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.19 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.09 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.42 
 
 		 419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.51 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.35 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.72 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.67 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  41.53 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  42.03 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.79 
 
 		 428 aa  319  7e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.23 
 
 		 418 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.88 
 
 		 420 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.56 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  39.91 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.32 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.03 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.33 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.51 
 
 		 419 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.56 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  42.96 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  42.36 
 
 		 416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  40.18 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  42.82 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.57 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.58 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.55 
 
 		 419 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.43 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  39.31 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.19 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  39.26 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.97 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  37.73 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  39.68 
 
 		 429 aa  302  8.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.38 
 
 		 413 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  38.71 
 
 		 418 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  42.59 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.34 
 
 		 421 aa  302  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  41.25 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.55 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.48 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.37 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.49 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.61 
 
 		 418 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.6 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.61 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  39.26 
 
 		 437 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.09 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  39.03 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  40.47 
 
 		 413 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.04 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.53 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  37.12 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.7 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.74 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.02 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  39.76 
 
 		 421 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.19 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.19 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  37.06 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.6 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.39 
 
 		 427 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.94 
 
 		 392 aa  279  8e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.39 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  37.1 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.94 
 
 		 427 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.44 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.22 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>