More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1961 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 
413 aa  848    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  71.91 
 
 
413 aa  617  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  63.97 
 
 
382 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  55.85 
 
 
416 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  57.14 
 
 
431 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  55.83 
 
 
418 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  53.49 
 
 
420 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  54.37 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.12 
 
 
423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  53.01 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  52.43 
 
 
419 aa  443  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.76 
 
 
428 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  53.85 
 
 
413 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.36 
 
 
424 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  53.14 
 
 
416 aa  431  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.64 
 
 
424 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.36 
 
 
424 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.4 
 
 
424 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  51.7 
 
 
418 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  50.72 
 
 
418 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  52.61 
 
 
421 aa  425  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  50.48 
 
 
418 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.57 
 
 
418 aa  421  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  50.97 
 
 
418 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.24 
 
 
418 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.48 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  49.28 
 
 
418 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  51.33 
 
 
404 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.92 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.88 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  52.05 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  51.95 
 
 
403 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  49.16 
 
 
429 aa  402  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  52.53 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  53.37 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.84 
 
 
417 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.52 
 
 
419 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  50.97 
 
 
406 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  50.48 
 
 
419 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.12 
 
 
417 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.94 
 
 
420 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.24 
 
 
420 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.28 
 
 
418 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.48 
 
 
424 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.81 
 
 
418 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.72 
 
 
431 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.36 
 
 
431 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.99 
 
 
415 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  50.12 
 
 
437 aa  386  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  47.09 
 
 
417 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.72 
 
 
421 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.81 
 
 
418 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.03 
 
 
419 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.03 
 
 
419 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.48 
 
 
417 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  48.55 
 
 
410 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.24 
 
 
417 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.12 
 
 
420 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  50.85 
 
 
417 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.87 
 
 
392 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.46 
 
 
420 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.1 
 
 
418 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.04 
 
 
421 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.73 
 
 
419 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.95 
 
 
418 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.88 
 
 
419 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.31 
 
 
427 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.68 
 
 
417 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.31 
 
 
427 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.31 
 
 
427 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.39 
 
 
416 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.67 
 
 
419 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.7 
 
 
423 aa  361  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  45.65 
 
 
418 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.88 
 
 
416 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.04 
 
 
429 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.17 
 
 
417 aa  358  8e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.95 
 
 
421 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.07 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.6 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.08 
 
 
427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.6 
 
 
427 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.08 
 
 
427 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46 
 
 
419 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.83 
 
 
415 aa  352  8e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.8 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46 
 
 
421 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  48.07 
 
 
416 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  45.33 
 
 
432 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  44.9 
 
 
415 aa  349  4e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  43.23 
 
 
422 aa  349  6e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.84 
 
 
427 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.44 
 
 
419 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  47.24 
 
 
423 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  44.79 
 
 
422 aa  346  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.71 
 
 
421 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.82 
 
 
421 aa  343  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.71 
 
 
431 aa  342  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  43.76 
 
 
431 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  43.66 
 
 
432 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>