More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1156 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 419 aa  851    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  70.63 
 
 		 416 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  70.46 
 
 		 423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.85 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.49 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.49 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.66 
 
 		 417 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  48.18 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.47 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.32 
 
 		 413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  48.07 
 
 		 413 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  44.89 
 
 		 420 aa  351  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  42.58 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  43.88 
 
 		 429 aa  342  7e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  42 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.54 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.54 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42 
 
 		 418 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.3 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.98 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  42.86 
 
 		 418 aa  333  5e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  45 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  41.43 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.98 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  42.55 
 
 		 418 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  50.28 
 
 		 382 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.14 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  45.41 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  41.06 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.67 
 
 		 418 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.19 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.53 
 
 		 424 aa  318  9e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  42.75 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.91 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  40.82 
 
 		 416 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.43 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.07 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.28 
 
 		 415 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  38.24 
 
 		 418 aa  308  9e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  39.52 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.33 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  39.52 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.57 
 
 		 421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.29 
 
 		 421 aa  306  6e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  40.34 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.48 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.94 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.52 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.48 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  41.89 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.19 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.76 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.66 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.71 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.17 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.81 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  45.98 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.33 
 
 		 423 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  40 
 
 		 437 aa  296  6e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.21 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  41.2 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.19 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.62 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.38 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.15 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.15 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.48 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.14 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  46.33 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.11 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.07 
 
 		 428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.24 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  42.31 
 
 		 417 aa  288  8e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.75 
 
 		 415 aa  288  9e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  41.59 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.29 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.86 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  45.98 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.57 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1364  homoaconitate hydratase family protein  38.21 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.48 
 
 		 416 aa  286  7e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.87 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.53 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.61 
 
 		 420 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.1 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.81 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.03 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  40 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  44.51 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.71 
 
 		 418 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.06 
 
 		 431 aa  275  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.09 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3159  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.94 
 
 		 431 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000477252  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.26 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.92 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.54 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.47 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.08 
 
 		 420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.04 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>