More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1167 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 
415 aa  849    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  64.55 
 
 
415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1593  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.5 
 
 
413 aa  558  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.83 
 
 
415 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1806  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.02 
 
 
414 aa  545  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.557493  normal  0.0145933 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0824  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.32 
 
 
415 aa  541  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2057  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.11 
 
 
415 aa  528  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376954  normal  0.299837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.6 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.13 
 
 
424 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.32 
 
 
431 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.84 
 
 
424 aa  355  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.89 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  44.87 
 
 
418 aa  348  7e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.83 
 
 
413 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  42.86 
 
 
429 aa  347  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  42.82 
 
 
418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.02 
 
 
418 aa  342  8e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.29 
 
 
431 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.03 
 
 
425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.12 
 
 
413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  47.63 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.65 
 
 
415 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.93 
 
 
423 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  41.55 
 
 
417 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.15 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  40.96 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  42.72 
 
 
418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  42.79 
 
 
416 aa  329  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.53 
 
 
424 aa  329  7e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  43.31 
 
 
404 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  42.34 
 
 
418 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  39.66 
 
 
416 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.72 
 
 
418 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.65 
 
 
424 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.21 
 
 
429 aa  322  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  40.87 
 
 
420 aa  322  8e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.3 
 
 
417 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.24 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.26 
 
 
417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.02 
 
 
417 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  42.24 
 
 
418 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.57 
 
 
418 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.57 
 
 
418 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.82 
 
 
417 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.06 
 
 
431 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.47 
 
 
419 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.21 
 
 
421 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.45 
 
 
419 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.43 
 
 
420 aa  316  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  41.77 
 
 
418 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.38 
 
 
428 aa  315  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.24 
 
 
420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  42.79 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.35 
 
 
419 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  41.97 
 
 
417 aa  311  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.11 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  41.97 
 
 
416 aa  308  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  38.52 
 
 
418 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.29 
 
 
424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.21 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  43.41 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.37 
 
 
421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  42.31 
 
 
417 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.39 
 
 
418 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.49 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.49 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  41.91 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  39.95 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.91 
 
 
431 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  41.02 
 
 
413 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.31 
 
 
421 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.33 
 
 
419 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.14 
 
 
419 aa  295  8e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  41.84 
 
 
421 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.06 
 
 
416 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.35 
 
 
418 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.3 
 
 
416 aa  293  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.3 
 
 
417 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.52 
 
 
418 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  39.05 
 
 
418 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  41.91 
 
 
403 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.19 
 
 
417 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  40.48 
 
 
417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  39.57 
 
 
423 aa  289  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  39.52 
 
 
424 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.42 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.12 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.5 
 
 
419 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.75 
 
 
419 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  38.71 
 
 
432 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.8 
 
 
422 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  37.14 
 
 
422 aa  277  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.75 
 
 
420 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.67 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  38.39 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.57 
 
 
419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.43 
 
 
421 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.33 
 
 
392 aa  270  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>