More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1593 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0824  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  86.2 
 
 		 415 aa  714    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1806  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  84.5 
 
 		 414 aa  703    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.557493  normal  0.0145933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2057  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  83.29 
 
 		 415 aa  687    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376954  normal  0.299837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1593  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 413 aa  837    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.5 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  61.8 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  61.11 
 
 		 415 aa  524  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  42.45 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  43.78 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.58 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  41.83 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.93 
 
 		 415 aa  316  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  44.74 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  42.65 
 
 		 416 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.9 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.24 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.58 
 
 		 413 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  41.53 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  41.29 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.07 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.29 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.19 
 
 		 431 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.06 
 
 		 423 aa  299  8e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  41.73 
 
 		 418 aa  298  9e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  42.11 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.89 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.23 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  38.9 
 
 		 418 aa  295  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.25 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  38.26 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.57 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.82 
 
 		 418 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  40.57 
 
 		 418 aa  292  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40 
 
 		 429 aa  292  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.96 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.72 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  39.28 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  41.26 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  42.07 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  41.55 
 
 		 413 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.6 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  40.25 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.43 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  38.31 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  40.68 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.04 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  38.95 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.9 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.04 
 
 		 418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.51 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.1 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.45 
 
 		 420 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.81 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.45 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.05 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  42.17 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.23 
 
 		 419 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.67 
 
 		 417 aa  279  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.91 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.05 
 
 		 418 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.85 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.89 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.68 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  39.81 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  38.78 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.81 
 
 		 421 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.86 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.42 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  39.47 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.01 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.58 
 
 		 418 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.01 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  41.56 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.65 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  37.53 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.39 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.39 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.27 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  39.23 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.42 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.7 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.2 
 
 		 416 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.81 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.46 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.41 
 
 		 419 aa  259  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.26 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  41.51 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  35.27 
 
 		 418 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  38.26 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  39.04 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  36.84 
 
 		 417 aa  253  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  36.84 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.08 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  35.4 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.15 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>