More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0275 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 415 aa  853    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  81.02 
 
 		 415 aa  702    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.55 
 
 		 415 aa  552  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2057  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.53 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376954  normal  0.299837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1593  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  61.8 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0824  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  60.83 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1806  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.04 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.557493  normal  0.0145933 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  42.55 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  40.62 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  43.84 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.44 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.31 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.72 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  41.36 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.65 
 
 		 418 aa  332  9e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.9 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.14 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.65 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.12 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.65 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.53 
 
 		 425 aa  325  6e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.42 
 
 		 424 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.35 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.37 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.61 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  41.06 
 
 		 418 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.12 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  42.17 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.86 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.65 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  40.92 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.29 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  42.58 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.52 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  40.68 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.86 
 
 		 419 aa  315  8e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  41.3 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.87 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.81 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  40.48 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.62 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.41 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.41 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.2 
 
 		 416 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.25 
 
 		 418 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.68 
 
 		 416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  42.13 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.58 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  42.11 
 
 		 418 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  42.67 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.65 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.71 
 
 		 420 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.44 
 
 		 417 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  42.04 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.88 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  40.92 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.36 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.59 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.65 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.45 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  40.91 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.65 
 
 		 417 aa  299  5e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.52 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.41 
 
 		 417 aa  298  8e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.96 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  39.61 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  41.43 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  39.86 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.47 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.43 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.62 
 
 		 421 aa  292  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.62 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.63 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  38.89 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  40.53 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.81 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.09 
 
 		 418 aa  288  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  40.92 
 
 		 416 aa  288  9e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.52 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.95 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  39.62 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.86 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  40.19 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  38.83 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.33 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.08 
 
 		 431 aa  283  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.13 
 
 		 423 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.96 
 
 		 417 aa  282  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  37.35 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.89 
 
 		 419 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.19 
 
 		 421 aa  278  9e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.52 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  37.35 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  38.35 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  38.41 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  40.82 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  39.08 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  36.53 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>