More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0824 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2057  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  84.02 
 
 		 415 aa  702    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376954  normal  0.299837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0824  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 415 aa  843    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1806  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  92.25 
 
 		 414 aa  772    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.557493  normal  0.0145933 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1593  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  86.2 
 
 		 413 aa  715    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.32 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  60.83 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  61.37 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  40.77 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  42.21 
 
 		 418 aa  315  9e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  44.85 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.46 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.57 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.57 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.1 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  39.57 
 
 		 420 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.86 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  41.45 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.47 
 
 		 418 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  39.47 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.05 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  42.34 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  41.26 
 
 		 416 aa  299  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.02 
 
 		 413 aa  299  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.72 
 
 		 413 aa  299  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  39 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  41.5 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.2 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.96 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.92 
 
 		 418 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.31 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  38.9 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  42.51 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.79 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.01 
 
 		 424 aa  289  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.47 
 
 		 431 aa  289  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.24 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  37.29 
 
 		 416 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.77 
 
 		 417 aa  285  9e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  38.1 
 
 		 418 aa  285  9e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.01 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  37.83 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  37.29 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.66 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  38.31 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  41.67 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.2 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  41.89 
 
 		 417 aa  279  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.4 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.15 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.55 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.66 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 		 418 aa  275  9e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.04 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 		 418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  39.95 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.98 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.05 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.42 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  40.53 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.72 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.45 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  39.42 
 
 		 417 aa  270  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.37 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.9 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.26 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.85 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.85 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.82 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.68 
 
 		 421 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  39.08 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.22 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  37.41 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  38.21 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.23 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  40.34 
 
 		 403 aa  262  8e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.26 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.87 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.93 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.53 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.41 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.29 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.31 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  35.42 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.73 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.56 
 
 		 427 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  39.08 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.44 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.74 
 
 		 417 aa  253  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.48 
 
 		 421 aa  252  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.44 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.36 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.36 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.09 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  38.31 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.71 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.58 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  39.43 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  36.8 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>