More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00580 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06521  Homoaconitase, mitochondrial Precursor (EC 4.2.1.36)(Homoaconitate hydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92412]  52.42 
 
 
776 aa  710    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00580  homoaconitate hydratase, putative  100 
 
 
728 aa  1491    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  50.92 
 
 
655 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  55.16 
 
 
677 aa  748    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  35.37 
 
 
420 aa  281  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  36.5 
 
 
418 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.22 
 
 
418 aa  273  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  35.86 
 
 
418 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  34.73 
 
 
418 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.3 
 
 
418 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.3 
 
 
418 aa  265  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  34 
 
 
419 aa  265  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  30.61 
 
 
643 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  35.38 
 
 
416 aa  254  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.29 
 
 
419 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.15 
 
 
423 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.11 
 
 
415 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  34.73 
 
 
423 aa  247  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.89 
 
 
418 aa  246  6.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.25 
 
 
419 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.32 
 
 
417 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.1 
 
 
417 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.48 
 
 
421 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  30.86 
 
 
645 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  30.86 
 
 
645 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  29.67 
 
 
642 aa  243  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  35.86 
 
 
410 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  34.59 
 
 
418 aa  243  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.1 
 
 
416 aa  242  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  29.11 
 
 
642 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.46 
 
 
419 aa  239  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  33.49 
 
 
417 aa  239  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  31.8 
 
 
641 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  34.43 
 
 
413 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.88 
 
 
417 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  32.27 
 
 
639 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.03 
 
 
416 aa  237  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  29.5 
 
 
640 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  32.29 
 
 
416 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.68 
 
 
431 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.74 
 
 
417 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  28.03 
 
 
642 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  29.2 
 
 
644 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.14 
 
 
421 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.52 
 
 
417 aa  234  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.84 
 
 
422 aa  234  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  27.45 
 
 
655 aa  232  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.71 
 
 
416 aa  231  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.46 
 
 
419 aa  230  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.58 
 
 
419 aa  230  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.17 
 
 
424 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34 
 
 
440 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.92 
 
 
417 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.12 
 
 
431 aa  229  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  28.89 
 
 
643 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  29.62 
 
 
640 aa  228  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.06 
 
 
424 aa  228  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  29.09 
 
 
646 aa  227  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  28.95 
 
 
657 aa  226  9e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.82 
 
 
435 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.86 
 
 
419 aa  225  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  32.54 
 
 
437 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  32.82 
 
 
424 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.29 
 
 
419 aa  225  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.68 
 
 
428 aa  224  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.96 
 
 
413 aa  224  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.94 
 
 
420 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.11 
 
 
418 aa  224  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  28.62 
 
 
657 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  27.37 
 
 
644 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  30.51 
 
 
429 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.68 
 
 
420 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.48 
 
 
421 aa  221  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  28.48 
 
 
641 aa  220  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.52 
 
 
429 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.46 
 
 
418 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.4 
 
 
424 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  29.53 
 
 
418 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  28.12 
 
 
645 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.65 
 
 
418 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.29 
 
 
431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  28.86 
 
 
642 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.84 
 
 
424 aa  218  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.81 
 
 
420 aa  218  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.74 
 
 
424 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.39 
 
 
413 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  30.52 
 
 
421 aa  217  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  28.37 
 
 
656 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.52 
 
 
424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  28.53 
 
 
658 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  27.92 
 
 
649 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  29.56 
 
 
661 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  28.92 
 
 
418 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  32.7 
 
 
382 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.26 
 
 
420 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.26 
 
 
431 aa  213  7e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  28.92 
 
 
418 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.01 
 
 
434 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  29.64 
 
 
644 aa  213  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  31.26 
 
 
417 aa  211  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>