More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4768 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  64.45 
 
 		 647 aa  827    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  53.01 
 
 		 648 aa  702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  53.35 
 
 		 645 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  52.09 
 
 		 648 aa  695    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  63.2 
 
 		 661 aa  833    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  73.8 
 
 		 649 aa  984    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  72.38 
 
 		 652 aa  941    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  64.19 
 
 		 660 aa  858    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  54.29 
 
 		 644 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  53.97 
 
 		 648 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 642 aa  661    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  52.02 
 
 		 646 aa  683    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 640 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  50.86 
 
 		 643 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  52.64 
 
 		 644 aa  696    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  69.21 
 
 		 647 aa  899    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  52.09 
 
 		 639 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  54.29 
 
 		 645 aa  718    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  71.43 
 
 		 656 aa  952    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  49.3 
 
 		 655 aa  662    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  62.27 
 
 		 668 aa  804    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  100 
 
 		 674 aa  1380    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  52.03 
 
 		 642 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  63.4 
 
 		 659 aa  830    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  52.42 
 
 		 641 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  48.92 
 
 		 645 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  48.92 
 
 		 645 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  47.32 
 
 		 657 aa  599  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  47.82 
 
 		 657 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  46.97 
 
 		 646 aa  597  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  47.34 
 
 		 644 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  47.5 
 
 		 660 aa  587  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  47.82 
 
 		 656 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  48.28 
 
 		 643 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  44.07 
 
 		 644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  44.53 
 
 		 642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  47.11 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  51.1 
 
 		 642 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  47.33 
 
 		 658 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  47.66 
 
 		 641 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  45.29 
 
 		 661 aa  553  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  46.49 
 
 		 641 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  33.09 
 
 		 760 aa  303  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  32.19 
 
 		 796 aa  295  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  31.66 
 
 		 754 aa  293  5e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  31.47 
 
 		 751 aa  290  7e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  33.43 
 
 		 755 aa  289  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  31.43 
 
 		 756 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  31.02 
 
 		 755 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  31.81 
 
 		 757 aa  283  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  30.88 
 
 		 792 aa  280  9e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  30.42 
 
 		 755 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  30.64 
 
 		 758 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  32.49 
 
 		 770 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  31.59 
 
 		 783 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  30.35 
 
 		 800 aa  274  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  30.74 
 
 		 780 aa  273  7e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  30.5 
 
 		 755 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  29.59 
 
 		 787 aa  268  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  30.6 
 
 		 765 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  29.9 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.49 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.85 
 
 		 418 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.33 
 
 		 418 aa  217  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.66 
 
 		 417 aa  209  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.97 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  29.86 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  29.93 
 
 		 429 aa  205  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.17 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.17 
 
 		 417 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  30.94 
 
 		 418 aa  204  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.29 
 
 		 415 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  31.41 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.13 
 
 		 420 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  27.46 
 
 		 763 aa  197  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  31.75 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  25.84 
 
 		 655 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  31.88 
 
 		 398 aa  196  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  27.24 
 
 		 855 aa  194  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  30.46 
 
 		 416 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  31.95 
 
 		 431 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.49 
 
 		 419 aa  190  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  33.25 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.41 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.79 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  30.35 
 
 		 416 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  30.02 
 
 		 431 aa  186  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.05 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  32.21 
 
 		 424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.74 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.86 
 
 		 427 aa  185  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.86 
 
 		 427 aa  185  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00580  homoaconitate hydratase, putative  26.66 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  27.23 
 
 		 781 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  26.56 
 
 		 677 aa  184  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.74 
 
 		 416 aa  183  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1133  hypothetical protein  26.2 
 
 		 783 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753668  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0626  aconitate hydratase  27.36 
 
 		 895 aa  183  9.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.14 
 
 		 419 aa  183  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  30.41 
 
 		 432 aa  183  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>