More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5705 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  63.4 
 
 		 674 aa  816    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  63.43 
 
 		 652 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  55.57 
 
 		 645 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  55.49 
 
 		 644 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  100 
 
 		 659 aa  1329    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  65.53 
 
 		 660 aa  865    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  52.24 
 
 		 645 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  56.24 
 
 		 644 aa  713    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  54.71 
 
 		 648 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  62.38 
 
 		 647 aa  803    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  61.57 
 
 		 649 aa  817    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  51.39 
 
 		 639 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  55.73 
 
 		 648 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  62.58 
 
 		 656 aa  823    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  64.76 
 
 		 668 aa  851    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  48.92 
 
 		 640 aa  648    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 645 aa  726    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  56.57 
 
 		 646 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  61.9 
 
 		 647 aa  803    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  86.38 
 
 		 661 aa  1157    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  52.24 
 
 		 645 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  47.83 
 
 		 655 aa  639    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  55.19 
 
 		 648 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  48.53 
 
 		 642 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  51.86 
 
 		 641 aa  618  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  48.06 
 
 		 643 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  48.62 
 
 		 644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  46.36 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  48.77 
 
 		 656 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  50.85 
 
 		 660 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  47.66 
 
 		 646 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  47.96 
 
 		 657 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  49.46 
 
 		 642 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  48.45 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  47.2 
 
 		 657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  49.46 
 
 		 641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  45.19 
 
 		 642 aa  568  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  47.84 
 
 		 641 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  47.13 
 
 		 643 aa  555  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  47.29 
 
 		 658 aa  547  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  44.01 
 
 		 644 aa  541  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  44.84 
 
 		 661 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  31.92 
 
 		 754 aa  306  6e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  33.56 
 
 		 755 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  31.88 
 
 		 770 aa  295  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.11 
 
 		 796 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  31.47 
 
 		 780 aa  291  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.84 
 
 		 798 aa  290  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  32.17 
 
 		 760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  31.4 
 
 		 800 aa  287  5.999999999999999e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  31.05 
 
 		 787 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  30.43 
 
 		 756 aa  283  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  32.7 
 
 		 755 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  30.27 
 
 		 792 aa  281  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  31.04 
 
 		 755 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  30 
 
 		 783 aa  280  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  29.44 
 
 		 757 aa  277  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  30.52 
 
 		 758 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  29.95 
 
 		 755 aa  264  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  29.12 
 
 		 751 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  29.64 
 
 		 765 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.55 
 
 		 417 aa  232  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.97 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.97 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.79 
 
 		 417 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.04 
 
 		 431 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  32.04 
 
 		 419 aa  222  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.57 
 
 		 418 aa  222  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.55 
 
 		 419 aa  220  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  35.68 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.73 
 
 		 418 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  31.64 
 
 		 429 aa  216  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  32.3 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  36.82 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.89 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.36 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.13 
 
 		 419 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  33.75 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  26.67 
 
 		 906 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.52 
 
 		 420 aa  204  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.82 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  33.01 
 
 		 418 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  33.49 
 
 		 417 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.14 
 
 		 424 aa  203  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  27.46 
 
 		 753 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.91 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  27.46 
 
 		 753 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  26.49 
 
 		 905 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.82 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  27.46 
 
 		 761 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  27.46 
 
 		 753 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  27.46 
 
 		 761 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  31.69 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  34.68 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.61 
 
 		 434 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  32.87 
 
 		 432 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  27.18 
 
 		 753 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.21 
 
 		 421 aa  197  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.13 
 
 		 429 aa  197  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  26.01 
 
 		 905 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>