More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  49.38 
 
 		 640 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  55.32 
 
 		 645 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  52.41 
 
 		 644 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  61.57 
 
 		 659 aa  817    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  76.12 
 
 		 652 aa  998    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  52.64 
 
 		 646 aa  704    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  60.87 
 
 		 668 aa  779    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  60.49 
 
 		 661 aa  818    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  62.71 
 
 		 660 aa  856    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  51.32 
 
 		 643 aa  679    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  53.55 
 
 		 644 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  73.8 
 
 		 674 aa  962    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  55.47 
 
 		 648 aa  746    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  48.68 
 
 		 642 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  52.73 
 
 		 641 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  100 
 
 		 649 aa  1331    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  54.45 
 
 		 648 aa  729    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  51.09 
 
 		 655 aa  684    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  50.39 
 
 		 639 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  54.39 
 
 		 645 aa  714    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  68.54 
 
 		 647 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  73.46 
 
 		 656 aa  982    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  53.98 
 
 		 648 aa  724    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  63.73 
 
 		 647 aa  827    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  51.01 
 
 		 642 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  50.62 
 
 		 645 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  50.62 
 
 		 645 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  50.08 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  48.22 
 
 		 657 aa  598  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  49.15 
 
 		 656 aa  600  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  47.68 
 
 		 657 aa  598  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  46.08 
 
 		 646 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  48 
 
 		 660 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  43.91 
 
 		 644 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.83 
 
 		 658 aa  567  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  43.08 
 
 		 642 aa  558  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  45.41 
 
 		 643 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  44.22 
 
 		 661 aa  548  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  45.68 
 
 		 641 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  46.18 
 
 		 641 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  45.84 
 
 		 642 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  44.88 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  32.56 
 
 		 754 aa  325  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  32.68 
 
 		 755 aa  307  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  31.6 
 
 		 756 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  31.24 
 
 		 751 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  32.6 
 
 		 755 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  32.22 
 
 		 770 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  32.81 
 
 		 796 aa  298  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  31.6 
 
 		 760 aa  293  8e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  31.14 
 
 		 765 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  31.18 
 
 		 757 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  30.81 
 
 		 755 aa  290  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  31.01 
 
 		 800 aa  288  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  30.87 
 
 		 783 aa  287  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  32.5 
 
 		 780 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  31.13 
 
 		 755 aa  285  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  31.09 
 
 		 758 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  30.49 
 
 		 792 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  30.34 
 
 		 787 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.06 
 
 		 798 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.29 
 
 		 418 aa  240  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.29 
 
 		 418 aa  239  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.08 
 
 		 417 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  33.33 
 
 		 418 aa  233  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  34.68 
 
 		 418 aa  232  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.32 
 
 		 431 aa  231  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  29.67 
 
 		 655 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  32.38 
 
 		 429 aa  230  7e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.13 
 
 		 415 aa  229  8e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.61 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  28.04 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  31.82 
 
 		 419 aa  224  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.38 
 
 		 418 aa  221  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.93 
 
 		 420 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.17 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.85 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  32.14 
 
 		 416 aa  212  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.6 
 
 		 419 aa  211  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.7 
 
 		 420 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  32.14 
 
 		 418 aa  210  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.2 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  27.53 
 
 		 753 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  27.53 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.1 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  33.49 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  27.38 
 
 		 753 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  27.38 
 
 		 761 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  27.5 
 
 		 753 aa  207  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  27.95 
 
 		 753 aa  206  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.46 
 
 		 420 aa  206  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.97 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.2 
 
 		 431 aa  206  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.13 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.89 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.87 
 
 		 427 aa  204  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.09 
 
 		 427 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.09 
 
 		 427 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  33.07 
 
 		 420 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>