More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0660 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  51.98 
 
 		 796 aa  753    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  51.64 
 
 		 798 aa  777    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  60.92 
 
 		 783 aa  929    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  77.17 
 
 		 765 aa  1206    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  54.88 
 
 		 800 aa  786    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  52.42 
 
 		 787 aa  742    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  58.66 
 
 		 792 aa  890    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  52.5 
 
 		 770 aa  785    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  73.77 
 
 		 756 aa  1150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  76.03 
 
 		 755 aa  1196    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  76.12 
 
 		 760 aa  1212    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  57.09 
 
 		 754 aa  888    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  75.27 
 
 		 755 aa  1192    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  56.17 
 
 		 755 aa  862    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  75.13 
 
 		 757 aa  1174    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  61.95 
 
 		 751 aa  961    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  87.81 
 
 		 755 aa  1384    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  61.22 
 
 		 780 aa  909    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  100 
 
 		 758 aa  1565    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  38.2 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  38.2 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  36.33 
 
 		 655 aa  375  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  35.64 
 
 		 640 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  34.39 
 
 		 639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  35.82 
 
 		 641 aa  354  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.86 
 
 		 646 aa  352  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  33.84 
 
 		 643 aa  350  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  34.99 
 
 		 642 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  34.62 
 
 		 643 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  36.5 
 
 		 641 aa  347  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  35.56 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  33.7 
 
 		 642 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  34.47 
 
 		 641 aa  344  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  34.95 
 
 		 640 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  34.77 
 
 		 644 aa  337  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  34.21 
 
 		 642 aa  335  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  33.33 
 
 		 648 aa  335  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  32.97 
 
 		 648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  33.11 
 
 		 644 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  33.56 
 
 		 646 aa  321  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  32.61 
 
 		 645 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  31.91 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  32.69 
 
 		 648 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  33.24 
 
 		 644 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  33.63 
 
 		 657 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  34.22 
 
 		 656 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  33.24 
 
 		 644 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.66 
 
 		 661 aa  299  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  34.71 
 
 		 657 aa  298  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  32.51 
 
 		 645 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  34.47 
 
 		 658 aa  295  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.09 
 
 		 649 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  30.77 
 
 		 668 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  30.18 
 
 		 647 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  30.95 
 
 		 652 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  30.36 
 
 		 661 aa  272  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  30.88 
 
 		 659 aa  270  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.51 
 
 		 656 aa  269  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  30.78 
 
 		 674 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  29.95 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  35.76 
 
 		 660 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.13 
 
 		 840 aa  230  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  28.66 
 
 		 865 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  28.23 
 
 		 907 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  28.66 
 
 		 865 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  29.06 
 
 		 897 aa  225  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  29.17 
 
 		 855 aa  221  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  28.75 
 
 		 875 aa  219  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1402  aconitate hydratase 1  28.38 
 
 		 934 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.365694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4990  aconitate hydratase  28.84 
 
 		 895 aa  217  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  27.96 
 
 		 883 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  28.16 
 
 		 870 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23230  aconitate hydratase  29 
 
 		 867 aa  216  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  28.23 
 
 		 863 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  27.08 
 
 		 916 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  28.95 
 
 		 900 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2862  aconitate hydratase 1  28.98 
 
 		 899 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2637  aconitate hydratase 1  28.98 
 
 		 899 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  27.91 
 
 		 862 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  28.2 
 
 		 863 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3640  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.593974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2866  aconitate hydratase 1  27.02 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 864 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3627  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0135995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 907 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  28.2 
 
 		 862 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  27.83 
 
 		 862 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4724  aconitate hydratase  27.85 
 
 		 868 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3724  aconitate hydratase  27.75 
 
 		 907 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.489907  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3289  aconitate hydratase  27.94 
 
 		 866 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0578513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  27.75 
 
 		 907 aa  210  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  27.75 
 
 		 891 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  27.73 
 
 		 868 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1593  aconitate hydratase  27.31 
 
 		 907 aa  209  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  27.19 
 
 		 862 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3302  aconitate hydratase  28.01 
 
 		 907 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>