More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85181 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  52.87 
 
 		 796 aa  800    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  52.64 
 
 		 798 aa  825    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  71.43 
 
 		 783 aa  1157    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  54.86 
 
 		 754 aa  816    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  62.14 
 
 		 755 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  56.17 
 
 		 787 aa  809    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  66.37 
 
 		 792 aa  1090    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  56.71 
 
 		 770 aa  893    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  60.4 
 
 		 760 aa  899    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  61.34 
 
 		 765 aa  921    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  100 
 
 		 780 aa  1619    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  60.11 
 
 		 756 aa  902    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  61.08 
 
 		 758 aa  900    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  62.2 
 
 		 757 aa  929    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  54.38 
 
 		 751 aa  813    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  53.88 
 
 		 800 aa  840    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  61.32 
 
 		 755 aa  915    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  56.62 
 
 		 755 aa  847    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  59.08 
 
 		 755 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  37.42 
 
 		 655 aa  358  2.9999999999999997e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  37.33 
 
 		 645 aa  356  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  37.33 
 
 		 645 aa  356  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  35.03 
 
 		 639 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  34.2 
 
 		 640 aa  344  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  35.83 
 
 		 642 aa  343  9e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  35 
 
 		 640 aa  341  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  34.83 
 
 		 641 aa  340  9e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  35.92 
 
 		 643 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  35.12 
 
 		 643 aa  337  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  37.38 
 
 		 641 aa  331  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  33.66 
 
 		 642 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  34.84 
 
 		 646 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  34.88 
 
 		 644 aa  320  9e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  34.48 
 
 		 644 aa  319  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  33.88 
 
 		 642 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  34.2 
 
 		 648 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  31.87 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  36.38 
 
 		 641 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  31.96 
 
 		 642 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  34.2 
 
 		 648 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  34.11 
 
 		 645 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  33.28 
 
 		 644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  33.68 
 
 		 657 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  33.69 
 
 		 646 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  34.68 
 
 		 656 aa  300  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  34.22 
 
 		 644 aa  299  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  34.19 
 
 		 648 aa  299  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  33.48 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  34.12 
 
 		 645 aa  296  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  33.88 
 
 		 657 aa  294  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  31.47 
 
 		 659 aa  291  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  33.28 
 
 		 658 aa  290  9e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  33.53 
 
 		 661 aa  288  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  33.7 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  30.96 
 
 		 668 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  32.5 
 
 		 649 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  30.76 
 
 		 661 aa  283  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  30.96 
 
 		 652 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  31.54 
 
 		 674 aa  262  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  31.15 
 
 		 647 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.33 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  48.19 
 
 		 326 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  28.39 
 
 		 874 aa  230  8e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  30.22 
 
 		 840 aa  228  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  28.32 
 
 		 865 aa  227  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  28.48 
 
 		 865 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  28.37 
 
 		 873 aa  224  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.15 
 
 		 855 aa  221  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  28.88 
 
 		 872 aa  220  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  26.89 
 
 		 891 aa  220  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3028  aconitate hydratase  28.77 
 
 		 872 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4787  aconitate hydratase  27.02 
 
 		 875 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0629785  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03372  aconitate hydratase  28.3 
 
 		 863 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  28.57 
 
 		 864 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  28.29 
 
 		 862 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5861  aconitate hydratase  27.61 
 
 		 875 aa  215  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  27.94 
 
 		 871 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  27.93 
 
 		 873 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  27.78 
 
 		 863 aa  214  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4023  aconitate hydratase  28.95 
 
 		 871 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4142  aconitate hydratase  28.7 
 
 		 863 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1421  aconitate hydratase  28.84 
 
 		 868 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3587  aconitate hydratase  27.74 
 
 		 875 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  28.28 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  28.4 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2082  aconitate hydratase  28.32 
 
 		 873 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700898  normal  0.185792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23230  aconitate hydratase  28.21 
 
 		 867 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  28.39 
 
 		 863 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  29.29 
 
 		 875 aa  212  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  28.77 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  28.28 
 
 		 863 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3947  aconitate hydratase  28.95 
 
 		 867 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4724  aconitate hydratase  27.77 
 
 		 868 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  28.73 
 
 		 863 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  28.95 
 
 		 863 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3302  aconitate hydratase  29.44 
 
 		 907 aa  211  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  27.31 
 
 		 870 aa  211  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08420  aconitase  28.77 
 
 		 884 aa  210  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0660302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  29.44 
 
 		 907 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  29.44 
 
 		 907 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>