More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  60.62 
 
 		 661 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  54.6 
 
 		 645 aa  708    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  67.74 
 
 		 656 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  52.94 
 
 		 644 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  62.1 
 
 		 660 aa  807    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  53.7 
 
 		 644 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  54.95 
 
 		 648 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  55.23 
 
 		 646 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  61.21 
 
 		 668 aa  783    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  63.73 
 
 		 649 aa  846    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  61.9 
 
 		 659 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  54.8 
 
 		 645 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  64.45 
 
 		 674 aa  834    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  100 
 
 		 647 aa  1305    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  67.24 
 
 		 647 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  55.07 
 
 		 648 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  54.77 
 
 		 648 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  48.61 
 
 		 642 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  66.67 
 
 		 652 aa  849    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  48.51 
 
 		 655 aa  630  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  48.99 
 
 		 643 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  49.3 
 
 		 639 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  50.31 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  50.31 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  46.99 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  48.15 
 
 		 657 aa  599  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  46.67 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  48.38 
 
 		 656 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  49.45 
 
 		 660 aa  593  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  46.53 
 
 		 657 aa  591  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  47.82 
 
 		 644 aa  588  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  50 
 
 		 641 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  48.04 
 
 		 643 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  47.3 
 
 		 646 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  47.81 
 
 		 642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  47.97 
 
 		 641 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  47.42 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  47.16 
 
 		 658 aa  559  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  44.15 
 
 		 642 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  47.6 
 
 		 641 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  43.57 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  44.6 
 
 		 661 aa  538  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  30.9 
 
 		 754 aa  289  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  32.04 
 
 		 770 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  32.97 
 
 		 755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  29.25 
 
 		 800 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  29.99 
 
 		 796 aa  273  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  30.32 
 
 		 755 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  29.93 
 
 		 787 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  31.07 
 
 		 783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  31.51 
 
 		 798 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  32.11 
 
 		 760 aa  267  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  31.15 
 
 		 780 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  29.96 
 
 		 756 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.29 
 
 		 418 aa  259  9e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  29.15 
 
 		 751 aa  257  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  30.75 
 
 		 755 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  30 
 
 		 758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  29.4 
 
 		 757 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  30.63 
 
 		 792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.25 
 
 		 418 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  29.82 
 
 		 765 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.01 
 
 		 418 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  31.73 
 
 		 419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  29.41 
 
 		 755 aa  233  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  30.84 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  31.82 
 
 		 418 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.73 
 
 		 415 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.65 
 
 		 418 aa  220  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  35.87 
 
 		 424 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.16 
 
 		 416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.83 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.78 
 
 		 431 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.64 
 
 		 419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.43 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.43 
 
 		 417 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.89 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  32.95 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.36 
 
 		 419 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.43 
 
 		 424 aa  210  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.22 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  32.44 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.22 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.73 
 
 		 424 aa  209  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.81 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.92 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.62 
 
 		 427 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  32.54 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.97 
 
 		 416 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.15 
 
 		 420 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.73 
 
 		 431 aa  204  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.25 
 
 		 421 aa  204  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.75 
 
 		 418 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.3 
 
 		 419 aa  204  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  33.26 
 
 		 432 aa  203  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  31.83 
 
 		 437 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.24 
 
 		 427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.24 
 
 		 427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  32.06 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  32.03 
 
 		 431 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>