More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2861 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  61.55 
 
 
891 aa  1073    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  61.55 
 
 
891 aa  1073    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  49.54 
 
 
855 aa  852    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  54.48 
 
 
935 aa  962    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  62.23 
 
 
913 aa  1081    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  44.78 
 
 
862 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  55.32 
 
 
901 aa  1010    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  57.87 
 
 
861 aa  1014    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  54.48 
 
 
901 aa  920    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0120  aconitate hydratase  44.12 
 
 
865 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0330  aconitate hydratase  44.32 
 
 
877 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00865335  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  56.97 
 
 
907 aa  1043    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2820  aconitate hydratase  42.73 
 
 
868 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  68.27 
 
 
895 aa  1241    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  44.51 
 
 
867 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  63.03 
 
 
914 aa  1091    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  56.86 
 
 
907 aa  1040    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  56.86 
 
 
907 aa  1040    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  56.86 
 
 
907 aa  1040    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  55.5 
 
 
905 aa  935    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  45.05 
 
 
864 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  63.67 
 
 
891 aa  1124    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  63.74 
 
 
891 aa  1129    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  44.06 
 
 
862 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  63.79 
 
 
914 aa  1110    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  43.9 
 
 
885 aa  699    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  57.42 
 
 
939 aa  1048    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  57.85 
 
 
916 aa  1060    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  44.96 
 
 
870 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  55.5 
 
 
901 aa  920    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  55.92 
 
 
883 aa  1020    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  56.22 
 
 
934 aa  1025    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  50.85 
 
 
939 aa  876    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  65.34 
 
 
905 aa  1192    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  55.5 
 
 
905 aa  935    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1738  aconitate hydratase  45.05 
 
 
864 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  54.97 
 
 
907 aa  946    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  44.38 
 
 
864 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  62.88 
 
 
913 aa  1090    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  67.98 
 
 
914 aa  1243    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  55.44 
 
 
905 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  55.25 
 
 
937 aa  980    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  56.86 
 
 
907 aa  1040    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  52.36 
 
 
946 aa  919    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  64.23 
 
 
891 aa  1149    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  55.16 
 
 
905 aa  934    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2187  aconitate hydratase  44.76 
 
 
864 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  51.82 
 
 
945 aa  926    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  57.1 
 
 
927 aa  1017    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  65.6 
 
 
905 aa  1221    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  62.88 
 
 
890 aa  1114    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  52.6 
 
 
905 aa  917    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  55.87 
 
 
875 aa  1015    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  65.5 
 
 
931 aa  1215    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  50.97 
 
 
978 aa  889    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  55.35 
 
 
937 aa  973    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  65.12 
 
 
906 aa  1209    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  51.84 
 
 
966 aa  919    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  45.38 
 
 
888 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  44.96 
 
 
865 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  54.82 
 
 
905 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  66 
 
 
905 aa  1225    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  54.83 
 
 
984 aa  980    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  64.93 
 
 
910 aa  1143    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  66 
 
 
905 aa  1221    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  54.83 
 
 
984 aa  980    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  43.75 
 
 
885 aa  697    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  57.34 
 
 
935 aa  1048    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  44.46 
 
 
865 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  54.79 
 
 
901 aa  912    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  51.6 
 
 
884 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  58.78 
 
 
907 aa  1041    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  57.09 
 
 
906 aa  1026    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  64.18 
 
 
915 aa  1178    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  65.54 
 
 
891 aa  1165    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  55.5 
 
 
905 aa  934    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  45.02 
 
 
864 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  55.96 
 
 
942 aa  1013    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  56.55 
 
 
940 aa  970    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  56.53 
 
 
907 aa  1025    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1421  aconitate hydratase  43.3 
 
 
868 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  66.52 
 
 
896 aa  1218    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  44.23 
 
 
863 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  44.34 
 
 
863 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  60.17 
 
 
914 aa  1060    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  42.73 
 
 
872 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  57.63 
 
 
908 aa  1023    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  43.64 
 
 
870 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  100 
 
 
891 aa  1833    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  55.9 
 
 
905 aa  936    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  44.57 
 
 
865 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  63.49 
 
 
910 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  45.49 
 
 
868 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  53.27 
 
 
887 aa  931    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  56.63 
 
 
936 aa  1024    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  55.5 
 
 
905 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  45.02 
 
 
864 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3827  aconitate hydratase  43.89 
 
 
863 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  57.08 
 
 
926 aa  1047    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  55.03 
 
 
922 aa  944    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>