More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0618 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  57.04 
 
 		 891 aa  1023    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  57.04 
 
 		 891 aa  1023    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  59.81 
 
 		 938 aa  1073    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  58.23 
 
 		 935 aa  1040    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  59.81 
 
 		 913 aa  1055    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  42.35 
 
 		 862 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  55.96 
 
 		 901 aa  1033    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  53.6 
 
 		 861 aa  982    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  54.78 
 
 		 901 aa  967    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0120  aconitate hydratase  42.32 
 
 		 865 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0330  aconitate hydratase  43.72 
 
 		 877 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00865335  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  56.72 
 
 		 907 aa  1075    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  62.3 
 
 		 903 aa  1149    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  56.41 
 
 		 895 aa  1021    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  43 
 
 		 867 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  58.93 
 
 		 914 aa  1035    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2289  aconitase family protein  41.69 
 
 		 863 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  56.82 
 
 		 907 aa  1075    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  56.82 
 
 		 907 aa  1075    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  56.82 
 
 		 907 aa  1075    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  54.52 
 
 		 905 aa  967    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  43.6 
 
 		 864 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  53.23 
 
 		 873 aa  907    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  57.52 
 
 		 942 aa  1062    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  42.7 
 
 		 862 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  59.36 
 
 		 914 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  41.86 
 
 		 885 aa  701    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  55.93 
 
 		 939 aa  1038    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  59.98 
 
 		 916 aa  1118    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  43.25 
 
 		 870 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  55.57 
 
 		 901 aa  976    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  51.39 
 
 		 883 aa  956    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  61.84 
 
 		 934 aa  1143    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  55.67 
 
 		 939 aa  957    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  54.44 
 
 		 905 aa  1004    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  54.52 
 
 		 905 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1738  aconitate hydratase  43.49 
 
 		 864 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  59.74 
 
 		 907 aa  1068    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  42.24 
 
 		 864 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  59.36 
 
 		 913 aa  1045    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  54.78 
 
 		 914 aa  1008    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0143  aconitate hydratase  42.84 
 
 		 864 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  53.98 
 
 		 905 aa  952    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  58.52 
 
 		 937 aa  1039    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  56.82 
 
 		 907 aa  1075    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  55.83 
 
 		 946 aa  1014    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  57.56 
 
 		 891 aa  1030    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  54.41 
 
 		 905 aa  968    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2187  aconitate hydratase  43.14 
 
 		 864 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  55.45 
 
 		 945 aa  980    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  59.47 
 
 		 927 aa  1048    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  55.01 
 
 		 905 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  54.19 
 
 		 890 aa  973    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  49.62 
 
 		 905 aa  903    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  52.31 
 
 		 875 aa  978    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  54.52 
 
 		 931 aa  1028    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  53.18 
 
 		 978 aa  928    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  54.07 
 
 		 937 aa  944    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  54.9 
 
 		 906 aa  1042    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  52.76 
 
 		 966 aa  955    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  43.93 
 
 		 888 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  53.55 
 
 		 905 aa  957    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  41.73 
 
 		 861 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  54.58 
 
 		 905 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  58.18 
 
 		 984 aa  1051    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  60.92 
 
 		 910 aa  1068    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  54.33 
 
 		 905 aa  1030    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  58.18 
 
 		 984 aa  1051    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  41.53 
 
 		 885 aa  686    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  55.42 
 
 		 935 aa  1038    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  42.87 
 
 		 865 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  54.94 
 
 		 901 aa  976    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  51.63 
 
 		 884 aa  899    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  58.51 
 
 		 907 aa  1068    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  61.46 
 
 		 906 aa  1145    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  55.54 
 
 		 915 aa  1045    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  55.65 
 
 		 891 aa  990    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  54.19 
 
 		 905 aa  958    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  43.06 
 
 		 864 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  57.52 
 
 		 942 aa  1062    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  100 
 
 		 940 aa  1893    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  56.36 
 
 		 907 aa  1047    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1421  aconitate hydratase  41.95 
 
 		 868 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  57.43 
 
 		 896 aa  1036    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  58.95 
 
 		 914 aa  1053    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  43.88 
 
 		 872 aa  711    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  55.06 
 
 		 908 aa  970    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  42.37 
 
 		 870 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  56.65 
 
 		 891 aa  1039    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  54.09 
 
 		 905 aa  961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  43.3 
 
 		 865 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  60.49 
 
 		 910 aa  1058    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  43.24 
 
 		 868 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  52.68 
 
 		 887 aa  946    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  58.3 
 
 		 936 aa  1051    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  54.19 
 
 		 905 aa  958    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  43.06 
 
 		 864 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  62.96 
 
 		 926 aa  1148    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  55.87 
 
 		 922 aa  974    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  45.42 
 
 		 854 aa  722    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>