More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0330 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  44.39 
 
 		 891 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  44.39 
 
 		 891 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  42.07 
 
 		 855 aa  703    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  43.14 
 
 		 935 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  45.72 
 
 		 913 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  44.6 
 
 		 891 aa  706    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  43.67 
 
 		 901 aa  745    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  43.14 
 
 		 861 aa  725    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  42.16 
 
 		 901 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0464  aconitate hydratase  43.62 
 
 		 894 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.197482 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0330  aconitate hydratase  100 
 
 		 877 aa  1761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00865335  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  43.24 
 
 		 907 aa  745    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  45.07 
 
 		 903 aa  729    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  44.02 
 
 		 895 aa  715    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  43.52 
 
 		 920 aa  777    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  45.05 
 
 		 914 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1634  aconitate hydratase  43.82 
 
 		 890 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.305003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  43.13 
 
 		 907 aa  744    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  43.13 
 
 		 907 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  43.13 
 
 		 907 aa  744    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  668    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  44.96 
 
 		 914 aa  733    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  45.1 
 
 		 891 aa  738    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  44.87 
 
 		 891 aa  735    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  668    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  45.54 
 
 		 914 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  41.11 
 
 		 939 aa  698    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  42.08 
 
 		 916 aa  718    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  43.76 
 
 		 870 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  41.62 
 
 		 901 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  41.94 
 
 		 883 aa  700    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  41.95 
 
 		 934 aa  695    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  44 
 
 		 905 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2486  aconitate hydratase  39.27 
 
 		 937 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  44.03 
 
 		 907 aa  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3665  aconitate hydratase  39.33 
 
 		 941 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  44.93 
 
 		 913 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  43.85 
 
 		 914 aa  730    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  41.91 
 
 		 905 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  43.13 
 
 		 907 aa  744    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  44.85 
 
 		 891 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  41.8 
 
 		 905 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1822  aconitate hydratase  42.15 
 
 		 862 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.490581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  42.2 
 
 		 945 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  42.49 
 
 		 927 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  44.16 
 
 		 905 aa  719    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  44.85 
 
 		 890 aa  697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  40.49 
 
 		 905 aa  687    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  42.71 
 
 		 875 aa  700    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  41.63 
 
 		 931 aa  694    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  43.8 
 
 		 937 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  42.83 
 
 		 906 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  71.61 
 
 		 888 aa  1194    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  42.96 
 
 		 865 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  41.31 
 
 		 905 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  39.34 
 
 		 942 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  43.69 
 
 		 905 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  43.52 
 
 		 984 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  43.95 
 
 		 910 aa  723    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  43.51 
 
 		 905 aa  705    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  43.52 
 
 		 984 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  40.96 
 
 		 935 aa  696    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  45.28 
 
 		 873 aa  700    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  41.22 
 
 		 901 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  47.1 
 
 		 884 aa  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  44.01 
 
 		 907 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  43.81 
 
 		 906 aa  692    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  40.98 
 
 		 915 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  44.51 
 
 		 891 aa  691    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  42.04 
 
 		 905 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  41.44 
 
 		 840 aa  662    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  39.34 
 
 		 942 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  43.69 
 
 		 907 aa  742    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  44.55 
 
 		 874 aa  677    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  45.16 
 
 		 896 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2192  aconitate hydratase  44.38 
 
 		 891 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000787755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0954  aconitate hydratase  41.99 
 
 		 868 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  45.49 
 
 		 914 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  42.47 
 
 		 905 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  43.05 
 
 		 908 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0452  aconitate hydratase  44.08 
 
 		 894 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  44.66 
 
 		 891 aa  733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  42.04 
 
 		 905 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0212  aconitate hydratase  45.05 
 
 		 895 aa  715    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  45.1 
 
 		 910 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1903  aconitate hydratase  46.46 
 
 		 913 aa  746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189889  normal  0.77377 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  40.36 
 
 		 887 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  40.49 
 
 		 936 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  42.04 
 
 		 905 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1412  aconitate hydratase  43.43 
 
 		 901 aa  737    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.881286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  43.11 
 
 		 905 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  43.29 
 
 		 926 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  43.99 
 
 		 922 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  59.55 
 
 		 854 aa  929    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  42.38 
 
 		 919 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  43.87 
 
 		 895 aa  700    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>