More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2820 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  45.15 
 
 		 891 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  45.15 
 
 		 891 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  44.04 
 
 		 903 aa  712    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  41.99 
 
 		 935 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  43.9 
 
 		 913 aa  698    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  75.89 
 
 		 862 aa  1376    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  41.71 
 
 		 901 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  44.92 
 
 		 861 aa  742    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  42.77 
 
 		 901 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0120  aconitate hydratase  75.75 
 
 		 865 aa  1361    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  75.98 
 
 		 861 aa  1388    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  43.28 
 
 		 907 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2820  aconitate hydratase  100 
 
 		 868 aa  1797    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  43.06 
 
 		 895 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  76.93 
 
 		 867 aa  1399    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  44.29 
 
 		 914 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2289  aconitase family protein  73.56 
 
 		 863 aa  1335    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  43.28 
 
 		 907 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  43.28 
 
 		 907 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  43.28 
 
 		 907 aa  726    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  42.76 
 
 		 905 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  75.69 
 
 		 864 aa  1352    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  44.51 
 
 		 891 aa  720    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  44.39 
 
 		 891 aa  716    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  74.45 
 
 		 862 aa  1352    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  44.96 
 
 		 914 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  70.46 
 
 		 885 aa  1292    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  44.08 
 
 		 939 aa  729    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  44.04 
 
 		 916 aa  734    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  77.74 
 
 		 870 aa  1388    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  43.62 
 
 		 901 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  44.69 
 
 		 883 aa  736    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  44.21 
 
 		 934 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  43.12 
 
 		 905 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  42.69 
 
 		 905 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1738  aconitate hydratase  75.58 
 
 		 864 aa  1350    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  43 
 
 		 907 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  76 
 
 		 864 aa  1368    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  44.84 
 
 		 913 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  42.25 
 
 		 914 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0143  aconitate hydratase  76.27 
 
 		 864 aa  1358    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  42.64 
 
 		 905 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  42.44 
 
 		 937 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  43.28 
 
 		 907 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  43.94 
 
 		 891 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  42.58 
 
 		 905 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2187  aconitate hydratase  76.09 
 
 		 864 aa  1356    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  43.85 
 
 		 942 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  43.19 
 
 		 927 aa  679    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  42.18 
 
 		 905 aa  695    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  43.36 
 
 		 890 aa  696    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  39.82 
 
 		 905 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  44.13 
 
 		 875 aa  736    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  42.67 
 
 		 931 aa  716    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  43.04 
 
 		 873 aa  661    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  41.78 
 
 		 937 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  42.99 
 
 		 906 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  39.54 
 
 		 966 aa  648    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  41.9 
 
 		 919 aa  692    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  74.43 
 
 		 865 aa  1351    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  41.53 
 
 		 905 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1666  aconitate hydratase  76.61 
 
 		 867 aa  1380    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  42.29 
 
 		 905 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  40.93 
 
 		 984 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  44.12 
 
 		 910 aa  725    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  42.92 
 
 		 905 aa  703    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  40.93 
 
 		 984 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  70.57 
 
 		 885 aa  1295    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  44.06 
 
 		 935 aa  730    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  75.55 
 
 		 865 aa  1353    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  43.07 
 
 		 901 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  43.91 
 
 		 884 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  43.58 
 
 		 907 aa  690    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  42.28 
 
 		 906 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  43.09 
 
 		 915 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  44.06 
 
 		 891 aa  692    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  42.29 
 
 		 905 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  76.5 
 
 		 864 aa  1365    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  43.85 
 
 		 942 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  42.78 
 
 		 907 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1421  aconitate hydratase  76.55 
 
 		 868 aa  1409    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  44.16 
 
 		 896 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  77.05 
 
 		 863 aa  1403    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  77.16 
 
 		 863 aa  1405    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  43.62 
 
 		 914 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  75.72 
 
 		 872 aa  1384    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  41.88 
 
 		 908 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  76.39 
 
 		 870 aa  1388    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  42.73 
 
 		 891 aa  696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  42.58 
 
 		 905 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  76.55 
 
 		 865 aa  1368    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  43.64 
 
 		 910 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  75.98 
 
 		 868 aa  1394    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  41.67 
 
 		 887 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  43.06 
 
 		 936 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  42.29 
 
 		 905 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  76.5 
 
 		 864 aa  1365    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3827  aconitate hydratase  77.05 
 
 		 863 aa  1400    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  42.55 
 
 		 926 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  41.07 
 
 		 922 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>