More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0891 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  51.06 
 
 		 891 aa  873    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  51.06 
 
 		 891 aa  873    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  49.15 
 
 		 891 aa  874    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  51.72 
 
 		 935 aa  905    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  53.33 
 
 		 913 aa  900    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  49.73 
 
 		 901 aa  907    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  43.07 
 
 		 861 aa  690    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  61.65 
 
 		 901 aa  1126    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1342  aconitate hydratase 1  59.52 
 
 		 939 aa  1053    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00303441  hitchhiker  0.00141005 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0330  aconitate hydratase  42.29 
 
 		 877 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00865335  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  50.48 
 
 		 907 aa  931    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1358  aconitase  61.05 
 
 		 909 aa  1082    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  51.59 
 
 		 895 aa  894    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  41.5 
 
 		 867 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  54.42 
 
 		 914 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  50.48 
 
 		 907 aa  930    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  50.48 
 
 		 907 aa  930    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  50.48 
 
 		 907 aa  930    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1115    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  51.13 
 
 		 873 aa  879    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1114    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2486  aconitate hydratase  51.16 
 
 		 937 aa  917    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3665  aconitate hydratase  50.37 
 
 		 941 aa  897    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  54.13 
 
 		 914 aa  904    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  40.09 
 
 		 885 aa  660    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  51.71 
 
 		 939 aa  937    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  52.11 
 
 		 916 aa  939    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  49.36 
 
 		 895 aa  847    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  62.51 
 
 		 901 aa  1133    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  48.72 
 
 		 883 aa  909    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  51.43 
 
 		 934 aa  917    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  100 
 
 		 939 aa  1907    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  49.84 
 
 		 905 aa  892    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1114    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  51.54 
 
 		 907 aa  908    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  53.32 
 
 		 913 aa  906    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  49.58 
 
 		 914 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  60.38 
 
 		 905 aa  1112    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  52.62 
 
 		 937 aa  906    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  50.48 
 
 		 907 aa  930    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  60.8 
 
 		 946 aa  1125    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  50.85 
 
 		 891 aa  887    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  60.38 
 
 		 905 aa  1114    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1114    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  63.69 
 
 		 945 aa  1181    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  52.47 
 
 		 927 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  50.42 
 
 		 905 aa  909    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  50.53 
 
 		 890 aa  856    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  45.96 
 
 		 905 aa  837    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  47.98 
 
 		 875 aa  887    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  49.36 
 
 		 931 aa  891    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  59.55 
 
 		 978 aa  1083    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  52.12 
 
 		 937 aa  896    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  50.31 
 
 		 906 aa  906    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  62.07 
 
 		 966 aa  1137    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  42.42 
 
 		 888 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  60.7 
 
 		 905 aa  1115    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  59.87 
 
 		 905 aa  1097    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  54.4 
 
 		 920 aa  981    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  50.84 
 
 		 905 aa  920    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  50.78 
 
 		 984 aa  892    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  52.07 
 
 		 910 aa  902    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  49.9 
 
 		 905 aa  910    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  50.78 
 
 		 984 aa  892    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  51.3 
 
 		 935 aa  930    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  62.39 
 
 		 901 aa  1134    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  49.84 
 
 		 954 aa  886    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  50.74 
 
 		 907 aa  904    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  53.74 
 
 		 906 aa  968    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  49.36 
 
 		 915 aa  885    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  51.6 
 
 		 891 aa  886    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  60.59 
 
 		 905 aa  1113    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1151  aconitate hydratase  61.8 
 
 		 963 aa  1141    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  50.78 
 
 		 942 aa  904    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  55.67 
 
 		 940 aa  941    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  50.82 
 
 		 907 aa  901    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  51.48 
 
 		 896 aa  901    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  50.78 
 
 		 942 aa  904    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  40.89 
 
 		 863 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  53.92 
 
 		 914 aa  938    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  52.26 
 
 		 914 aa  954    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  50.16 
 
 		 908 aa  839    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  54.18 
 
 		 903 aa  953    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  50.85 
 
 		 891 aa  922    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  60.15 
 
 		 905 aa  1103    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1145  aconitate hydratase  60.1 
 
 		 972 aa  1087    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  53.5 
 
 		 910 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0452  aconitate hydratase  49.58 
 
 		 894 aa  846    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  48.65 
 
 		 887 aa  886    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  52.97 
 
 		 936 aa  898    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  60.59 
 
 		 905 aa  1113    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3024  aconitate hydratase  60.08 
 
 		 989 aa  1085    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0175547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  51.45 
 
 		 873 aa  889    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  53.23 
 
 		 926 aa  955    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  51.17 
 
 		 922 aa  905    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  46.12 
 
 		 854 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  49.42 
 
 		 919 aa  874    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  51.23 
 
 		 938 aa  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>