More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3665 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  52.25 
 
 		 891 aa  893    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  52.25 
 
 		 891 aa  893    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  52.75 
 
 		 935 aa  880    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  53.38 
 
 		 913 aa  907    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  50.75 
 
 		 901 aa  920    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  46.65 
 
 		 861 aa  840    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  57.34 
 
 		 901 aa  1034    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1145  aconitate hydratase  58.21 
 
 		 972 aa  1035    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  53.85 
 
 		 903 aa  932    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  50.21 
 
 		 907 aa  925    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  42.89 
 
 		 863 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  53.66 
 
 		 895 aa  928    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  42.9 
 
 		 867 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  52.95 
 
 		 914 aa  895    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  51.45 
 
 		 873 aa  863    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  50.21 
 
 		 907 aa  925    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  50.21 
 
 		 907 aa  925    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  50.21 
 
 		 907 aa  925    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1048    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  53.4 
 
 		 920 aa  970    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1342  aconitate hydratase 1  56.89 
 
 		 939 aa  1013    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00303441  hitchhiker  0.00141005 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1048    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  53.53 
 
 		 914 aa  897    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  41.31 
 
 		 885 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 939 aa  921    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  52.54 
 
 		 916 aa  942    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1151  aconitate hydratase  58.9 
 
 		 963 aa  1073    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  58.98 
 
 		 901 aa  1057    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  48.97 
 
 		 883 aa  886    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  51.09 
 
 		 934 aa  918    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  63.69 
 
 		 939 aa  1127    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  51.52 
 
 		 905 aa  899    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  50.53 
 
 		 907 aa  894    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  51.8 
 
 		 914 aa  932    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  53.32 
 
 		 913 aa  896    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  50.8 
 
 		 914 aa  896    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  56.66 
 
 		 905 aa  1041    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  53.51 
 
 		 937 aa  892    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  50.21 
 
 		 907 aa  925    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  59.47 
 
 		 946 aa  1098    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  53.93 
 
 		 891 aa  945    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  56.77 
 
 		 905 aa  1043    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  100 
 
 		 945 aa  1910    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  54.36 
 
 		 927 aa  928    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  52.4 
 
 		 905 aa  943    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  50.11 
 
 		 890 aa  850    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  46.08 
 
 		 905 aa  798    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  48.79 
 
 		 875 aa  874    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  49.79 
 
 		 931 aa  902    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  56.72 
 
 		 978 aa  1030    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  51.9 
 
 		 937 aa  883    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  52.19 
 
 		 906 aa  939    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  59.73 
 
 		 966 aa  1089    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  49.89 
 
 		 954 aa  878    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  44.36 
 
 		 865 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  57.14 
 
 		 905 aa  1043    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  52.51 
 
 		 905 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  51.14 
 
 		 984 aa  915    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  53.97 
 
 		 910 aa  934    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  51.91 
 
 		 905 aa  932    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  51.14 
 
 		 984 aa  915    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  40.88 
 
 		 885 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  50.42 
 
 		 935 aa  921    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1664  aconitate hydratase  41.9 
 
 		 874 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  59.26 
 
 		 901 aa  1056    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  47.31 
 
 		 884 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  52.03 
 
 		 907 aa  917    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  54.17 
 
 		 906 aa  965    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  49.41 
 
 		 915 aa  907    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  51.05 
 
 		 891 aa  879    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1051    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  49.51 
 
 		 891 aa  865    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  52.55 
 
 		 942 aa  911    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  54.85 
 
 		 940 aa  919    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  50.11 
 
 		 907 aa  886    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1358  aconitase  56.56 
 
 		 909 aa  998    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  51.66 
 
 		 895 aa  887    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  42.78 
 
 		 863 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  42.03 
 
 		 863 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  54.25 
 
 		 914 aa  926    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3024  aconitate hydratase  57.94 
 
 		 989 aa  1056    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0175547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  50.82 
 
 		 908 aa  868    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0452  aconitate hydratase  51.02 
 
 		 894 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  51.82 
 
 		 891 aa  926    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  56.98 
 
 		 905 aa  1045    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  52.83 
 
 		 910 aa  900    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  42.32 
 
 		 868 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  48.29 
 
 		 887 aa  866    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  52.72 
 
 		 936 aa  890    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  57.08 
 
 		 905 aa  1051    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  52.55 
 
 		 942 aa  911    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3827  aconitate hydratase  42.05 
 
 		 863 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  54.29 
 
 		 926 aa  959    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  50.94 
 
 		 922 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  43.55 
 
 		 854 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  51.94 
 
 		 919 aa  916    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  50.63 
 
 		 938 aa  888    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>