More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1467 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  50.06 
 
 		 891 aa  832    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  50.06 
 
 		 891 aa  832    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  67.38 
 
 		 855 aa  1156    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  47.3 
 
 		 935 aa  797    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  48.16 
 
 		 913 aa  822    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  813    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  47.8 
 
 		 901 aa  829    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  49.12 
 
 		 861 aa  820    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  48.83 
 
 		 901 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1342  aconitate hydratase 1  46.26 
 
 		 939 aa  769    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00303441  hitchhiker  0.00141005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  52.19 
 
 		 874 aa  821    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  48.75 
 
 		 907 aa  850    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  48.21 
 
 		 920 aa  853    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  50.8 
 
 		 895 aa  867    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  51.8 
 
 		 903 aa  889    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  48.82 
 
 		 914 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  49.83 
 
 		 895 aa  853    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  48.81 
 
 		 907 aa  849    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  48.81 
 
 		 907 aa  849    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  48.81 
 
 		 907 aa  849    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  813    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  48.63 
 
 		 891 aa  818    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  48.45 
 
 		 891 aa  817    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  49.1 
 
 		 914 aa  851    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  49.05 
 
 		 914 aa  822    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  46.78 
 
 		 939 aa  806    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  47.7 
 
 		 916 aa  824    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  100 
 
 		 840 aa  1712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  48.14 
 
 		 901 aa  783    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  47.99 
 
 		 883 aa  828    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  50.11 
 
 		 934 aa  878    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  45.11 
 
 		 939 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  48.75 
 
 		 905 aa  838    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1358  aconitase  47.91 
 
 		 909 aa  773    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  48.27 
 
 		 907 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  48.32 
 
 		 913 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  49.43 
 
 		 914 aa  833    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  49.83 
 
 		 873 aa  789    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  49.61 
 
 		 905 aa  819    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  47.47 
 
 		 937 aa  803    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  48.81 
 
 		 907 aa  849    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  44.97 
 
 		 938 aa  735    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  50.11 
 
 		 891 aa  826    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  49.33 
 
 		 905 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0452  aconitate hydratase  49.54 
 
 		 894 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  45.97 
 
 		 927 aa  737    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  48.38 
 
 		 905 aa  859    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  47.07 
 
 		 890 aa  774    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  46.94 
 
 		 905 aa  801    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  49.59 
 
 		 875 aa  839    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  46.84 
 
 		 931 aa  806    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  49.37 
 
 		 937 aa  816    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  49.15 
 
 		 906 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  43.18 
 
 		 888 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0464  aconitate hydratase  49.31 
 
 		 894 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.197482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  48.48 
 
 		 905 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  46.9 
 
 		 891 aa  769    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  48.81 
 
 		 905 aa  860    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  47.55 
 
 		 984 aa  830    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  49.33 
 
 		 910 aa  849    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  49.15 
 
 		 905 aa  863    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  47.55 
 
 		 984 aa  830    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  49.1 
 
 		 905 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  46.43 
 
 		 935 aa  806    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  51.89 
 
 		 873 aa  826    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  49.27 
 
 		 901 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  47.99 
 
 		 884 aa  772    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  49.49 
 
 		 907 aa  827    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  50.34 
 
 		 906 aa  850    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  47.76 
 
 		 915 aa  810    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  43.79 
 
 		 891 aa  711    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  50.17 
 
 		 905 aa  820    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  43.96 
 
 		 954 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  45.03 
 
 		 942 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2486  aconitate hydratase  44.86 
 
 		 937 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  48.09 
 
 		 907 aa  818    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2192  aconitate hydratase  49.66 
 
 		 891 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000787755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  51.65 
 
 		 896 aa  869    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  48.53 
 
 		 905 aa  863    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1412  aconitate hydratase  47.8 
 
 		 901 aa  813    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.881286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  50.51 
 
 		 914 aa  838    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  43.57 
 
 		 871 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  46.08 
 
 		 908 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1903  aconitate hydratase  49.17 
 
 		 913 aa  847    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189889  normal  0.77377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  50.4 
 
 		 891 aa  870    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  50.17 
 
 		 905 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  45.03 
 
 		 942 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  49.05 
 
 		 910 aa  828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0212  aconitate hydratase  50.17 
 
 		 895 aa  837    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  47.77 
 
 		 887 aa  780    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  50.17 
 
 		 905 aa  820    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  43.21 
 
 		 863 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0954  aconitate hydratase  41.99 
 
 		 868 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  47.84 
 
 		 926 aa  800    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  47.23 
 
 		 922 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  44.59 
 
 		 854 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>