More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2876 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  57.29 
 
 		 891 aa  1051    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  57.29 
 
 		 891 aa  1051    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1664  aconitate hydratase  42.59 
 
 		 874 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  56.61 
 
 		 935 aa  1027    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  59.11 
 
 		 913 aa  1065    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  42.13 
 
 		 862 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  53.97 
 
 		 901 aa  1016    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  52.85 
 
 		 861 aa  973    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  50.65 
 
 		 901 aa  875    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0120  aconitate hydratase  42.62 
 
 		 865 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  54.14 
 
 		 907 aa  1028    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  69.84 
 
 		 954 aa  1334    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  55.49 
 
 		 895 aa  1023    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  58.58 
 
 		 914 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2289  aconitase family protein  42.36 
 
 		 863 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  54.14 
 
 		 907 aa  1030    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  54.14 
 
 		 907 aa  1030    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  54.14 
 
 		 907 aa  1030    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  50.71 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  41.53 
 
 		 864 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  55.88 
 
 		 891 aa  1027    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  55.21 
 
 		 891 aa  1023    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  43.01 
 
 		 862 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  57.99 
 
 		 914 aa  1056    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  41.98 
 
 		 885 aa  676    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  55.37 
 
 		 939 aa  1044    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  74.39 
 
 		 916 aa  1423    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  41.39 
 
 		 870 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 901 aa  864    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  51.01 
 
 		 883 aa  932    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  53.95 
 
 		 934 aa  1009    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  51.23 
 
 		 939 aa  870    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  55.86 
 
 		 905 aa  1020    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  50.6 
 
 		 905 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  56.4 
 
 		 907 aa  1003    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  41.96 
 
 		 864 aa  695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  59.07 
 
 		 913 aa  1064    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  56.32 
 
 		 914 aa  1050    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0143  aconitate hydratase  42.01 
 
 		 864 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  50.98 
 
 		 905 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  56.93 
 
 		 937 aa  1041    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  54.14 
 
 		 907 aa  1030    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  51.28 
 
 		 946 aa  894    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  58.81 
 
 		 891 aa  1082    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  50.82 
 
 		 905 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2187  aconitate hydratase  41.86 
 
 		 864 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  50.68 
 
 		 945 aa  917    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  70.61 
 
 		 927 aa  1303    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  54.34 
 
 		 905 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  56.11 
 
 		 890 aa  1044    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  48.49 
 
 		 905 aa  867    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  51.54 
 
 		 875 aa  961    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  55.63 
 
 		 931 aa  1037    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  48.68 
 
 		 978 aa  867    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  53.32 
 
 		 937 aa  993    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  54.38 
 
 		 906 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  48.17 
 
 		 966 aa  889    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  49.36 
 
 		 905 aa  870    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  57.49 
 
 		 903 aa  1058    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  54.6 
 
 		 905 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  58.55 
 
 		 984 aa  1097    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  59.33 
 
 		 910 aa  1093    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  54.7 
 
 		 905 aa  1031    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  58.55 
 
 		 984 aa  1097    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  41.94 
 
 		 885 aa  688    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  55.13 
 
 		 935 aa  1044    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  42.75 
 
 		 865 aa  689    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  50.33 
 
 		 901 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  51.36 
 
 		 884 aa  904    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  60.95 
 
 		 907 aa  1130    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  56.47 
 
 		 906 aa  1049    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  57.58 
 
 		 915 aa  1066    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  58.24 
 
 		 891 aa  1076    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  51.52 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  43.54 
 
 		 864 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  70.81 
 
 		 942 aa  1350    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  59.79 
 
 		 940 aa  1039    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  56.03 
 
 		 907 aa  1062    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1421  aconitate hydratase  40.53 
 
 		 868 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  57.94 
 
 		 896 aa  1071    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  60.79 
 
 		 914 aa  1118    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  41.8 
 
 		 872 aa  698    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  58.03 
 
 		 908 aa  1045    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  57.79 
 
 		 891 aa  1088    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  50.71 
 
 		 905 aa  878    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  42.34 
 
 		 865 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  58.17 
 
 		 910 aa  1064    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  41.71 
 
 		 868 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 887 aa  918    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  72.61 
 
 		 936 aa  1368    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  51.52 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  43.54 
 
 		 864 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  71.79 
 
 		 926 aa  1363    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  51.69 
 
 		 922 aa  942    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  42.86 
 
 		 854 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  55.2 
 
 		 919 aa  1032    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  100 
 
 		 938 aa  1924    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  40.68 
 
 		 861 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  47.21 
 
 		 873 aa  820    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  70.81 
 
 		 942 aa  1350    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>