More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2745 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  56.72 
 
 
891 aa  1016    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  56.72 
 
 
891 aa  1016    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  57.69 
 
 
920 aa  1088    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  55.17 
 
 
935 aa  1019    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  55.88 
 
 
913 aa  1012    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  51.16 
 
 
901 aa  928    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  51.06 
 
 
861 aa  928    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  50.27 
 
 
901 aa  865    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1151  aconitate hydratase  47.87 
 
 
963 aa  884    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  51.63 
 
 
907 aa  957    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2820  aconitate hydratase  41.64 
 
 
868 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  54.6 
 
 
895 aa  1001    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  51.32 
 
 
891 aa  911    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  55.82 
 
 
914 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  52 
 
 
907 aa  960    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  52 
 
 
907 aa  960    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  52 
 
 
907 aa  960    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  50.48 
 
 
905 aa  863    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  42.78 
 
 
864 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  55.11 
 
 
891 aa  1007    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  55.11 
 
 
891 aa  1008    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  55.3 
 
 
914 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  41.75 
 
 
885 aa  704    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  55.97 
 
 
939 aa  1043    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  74.47 
 
 
916 aa  1451    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  41.21 
 
 
870 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  50.27 
 
 
901 aa  868    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  50.37 
 
 
883 aa  932    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  53.28 
 
 
934 aa  983    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  49.84 
 
 
939 aa  872    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  54.49 
 
 
905 aa  989    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  50.38 
 
 
905 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1738  aconitate hydratase  42.78 
 
 
864 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  53.79 
 
 
907 aa  956    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  56.11 
 
 
913 aa  1014    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  54.14 
 
 
914 aa  1009    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0143  aconitate hydratase  42.37 
 
 
864 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  49.57 
 
 
905 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  54.95 
 
 
937 aa  1017    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  52 
 
 
907 aa  960    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  51.45 
 
 
946 aa  889    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  58.02 
 
 
891 aa  1057    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  50.38 
 
 
905 aa  866    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2187  aconitate hydratase  42.75 
 
 
864 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  50.43 
 
 
945 aa  902    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  67.16 
 
 
927 aa  1246    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  53.59 
 
 
905 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  54.9 
 
 
890 aa  1007    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  47.12 
 
 
905 aa  865    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  49.79 
 
 
875 aa  926    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  54.07 
 
 
931 aa  994    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  47.46 
 
 
978 aa  856    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  53.59 
 
 
937 aa  946    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  53.44 
 
 
906 aa  999    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  48.34 
 
 
966 aa  885    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  57.01 
 
 
903 aa  1045    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  42.9 
 
 
865 aa  700    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  48.11 
 
 
905 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  53.49 
 
 
905 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  58.22 
 
 
984 aa  1089    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  58.77 
 
 
910 aa  1073    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  54.18 
 
 
905 aa  1013    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  58.22 
 
 
984 aa  1089    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  41.84 
 
 
885 aa  706    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  55.93 
 
 
935 aa  1039    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  50.11 
 
 
901 aa  863    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  48.69 
 
 
884 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  58 
 
 
907 aa  1076    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  53.45 
 
 
906 aa  971    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  55.43 
 
 
915 aa  1023    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  55.32 
 
 
891 aa  1013    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  49.73 
 
 
905 aa  860    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  42.78 
 
 
864 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  84.38 
 
 
942 aa  1618    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  56.43 
 
 
940 aa  991    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  55.57 
 
 
907 aa  1035    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  57.37 
 
 
896 aa  1052    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  42.35 
 
 
863 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1664  aconitate hydratase  42.77 
 
 
874 aa  716    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  58.29 
 
 
914 aa  1079    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  100 
 
 
954 aa  1953    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  54.78 
 
 
908 aa  973    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  40.99 
 
 
870 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  56.75 
 
 
891 aa  1053    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  49.35 
 
 
905 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  42.86 
 
 
865 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  56.63 
 
 
910 aa  1021    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  41 
 
 
868 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  48.26 
 
 
887 aa  870    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  75.21 
 
 
936 aa  1410    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  49.73 
 
 
905 aa  860    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  42.78 
 
 
864 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3827  aconitate hydratase  42.67 
 
 
863 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  67.3 
 
 
926 aa  1286    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  49.68 
 
 
922 aa  915    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  55.79 
 
 
919 aa  1022    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  69.84 
 
 
938 aa  1333    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  42.15 
 
 
861 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  46.08 
 
 
873 aa  811    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  84.38 
 
 
942 aa  1618    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>