More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1151 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  51.15 
 
 
891 aa  890    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  51.15 
 
 
891 aa  890    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3665  aconitate hydratase  48.16 
 
 
941 aa  874    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265295  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  52.71 
 
 
935 aa  898    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  52.3 
 
 
913 aa  898    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1332    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  50.9 
 
 
901 aa  891    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  45.05 
 
 
861 aa  721    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  70.89 
 
 
901 aa  1348    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1342  aconitate hydratase 1  76.11 
 
 
939 aa  1474    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00303441  hitchhiker  0.00141005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0464  aconitate hydratase  50.41 
 
 
894 aa  891    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.197482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  50.05 
 
 
907 aa  916    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  52 
 
 
903 aa  919    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  52.36 
 
 
895 aa  899    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1358  aconitase  75.05 
 
 
909 aa  1436    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  52.22 
 
 
914 aa  880    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  51.58 
 
 
920 aa  924    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  50.16 
 
 
907 aa  914    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  50.16 
 
 
907 aa  914    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  50.16 
 
 
907 aa  914    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1332    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  51.05 
 
 
891 aa  892    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  51.05 
 
 
891 aa  889    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  51.06 
 
 
895 aa  871    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  52.22 
 
 
914 aa  875    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  40.24 
 
 
885 aa  648    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  52.16 
 
 
939 aa  928    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  52 
 
 
916 aa  931    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  71.52 
 
 
901 aa  1360    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3062  aconitate hydratase 1  50.59 
 
 
944 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.577163  normal  0.0664937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  51.61 
 
 
934 aa  919    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  61.8 
 
 
939 aa  1090    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  47.74 
 
 
905 aa  806    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1331    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  49.12 
 
 
891 aa  847    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  50.58 
 
 
907 aa  863    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3024  aconitate hydratase  76.71 
 
 
989 aa  1493    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0175547  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  52.11 
 
 
913 aa  885    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  50.36 
 
 
914 aa  889    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  70.94 
 
 
905 aa  1346    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  52.28 
 
 
937 aa  893    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  50.16 
 
 
907 aa  914    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  65.15 
 
 
946 aa  1239    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  52.3 
 
 
891 aa  913    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  70.52 
 
 
905 aa  1332    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1145  aconitate hydratase  86.34 
 
 
972 aa  1693    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  58.9 
 
 
945 aa  1073    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  51.44 
 
 
927 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  50.95 
 
 
905 aa  925    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  52.15 
 
 
890 aa  915    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  46.7 
 
 
905 aa  808    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  47.03 
 
 
875 aa  836    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  48.81 
 
 
931 aa  885    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  76.25 
 
 
978 aa  1485    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  50.22 
 
 
937 aa  853    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  51.15 
 
 
906 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  80.46 
 
 
966 aa  1579    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2192  aconitate hydratase  50.1 
 
 
891 aa  880    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000787755 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1332    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  69.45 
 
 
905 aa  1319    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  50.63 
 
 
905 aa  924    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  50.36 
 
 
984 aa  883    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  51.74 
 
 
910 aa  900    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  51.55 
 
 
905 aa  942    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  50.36 
 
 
984 aa  883    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  53 
 
 
914 aa  964    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  51.74 
 
 
935 aa  921    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  70.47 
 
 
901 aa  1335    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  48.03 
 
 
874 aa  820    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  51.68 
 
 
907 aa  890    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  54.12 
 
 
906 aa  984    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  48.24 
 
 
915 aa  882    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  51.63 
 
 
891 aa  904    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  71.46 
 
 
905 aa  1354    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  50.26 
 
 
942 aa  893    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  54.42 
 
 
940 aa  900    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  51 
 
 
907 aa  914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1151  aconitate hydratase  100 
 
 
963 aa  1979    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  51.37 
 
 
896 aa  886    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2486  aconitate hydratase  50.47 
 
 
937 aa  894    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0452  aconitate hydratase  50.47 
 
 
894 aa  888    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694166  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  54.13 
 
 
914 aa  938    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1331    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  51.49 
 
 
908 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1903  aconitate hydratase  53.33 
 
 
913 aa  917    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189889  normal  0.77377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  50.94 
 
 
891 aa  914    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  70.52 
 
 
905 aa  1335    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  47.87 
 
 
954 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  53.18 
 
 
910 aa  890    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1332    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  48.62 
 
 
887 aa  862    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  51.33 
 
 
936 aa  888    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  71.46 
 
 
905 aa  1354    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  48.67 
 
 
873 aa  821    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  52.9 
 
 
926 aa  937    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  51.47 
 
 
922 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  49.53 
 
 
919 aa  868    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  49.89 
 
 
938 aa  887    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  70.73 
 
 
905 aa  1331    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  47.83 
 
 
873 aa  809    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>