More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1233 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1233  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.9 
 
 		 296 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.46 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.46 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.162535  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.46 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.08 
 
 		 296 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.43 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1803  peptide ABC transporter, permease protein  83.78 
 
 		 296 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.43 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.43 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.381943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.43 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.74 
 
 		 296 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757763  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.41 
 
 		 296 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.43 
 
 		 296 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2582  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.07 
 
 		 296 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.04 
 
 		 296 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1287  peptide ABC transporter, permease protein  51.22 
 
 		 295 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0477  peptide transport system permease protein SapC  53.26 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003818  peptide transport system permease protein SapC  52.61 
 
 		 295 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01868  hypothetical protein  52.96 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  51.25 
 
 		 281 aa  295  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1933  peptide ABC transporter, permease protein SapC  49.48 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0171727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2333  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.368345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01269  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  49.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1830  peptide ABC transporter, permease protein SapC  49.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1499  peptide ABC transporter, permease protein SapC  49.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01280  hypothetical protein  49.48 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1406  peptide ABC transporter, permease protein SapC  49.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.319126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1528  peptide ABC transporter, permease protein SapC  49.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1823  peptide transport system permease SapC  49.83 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1456  peptide ABC transporter, permease protein SapC  49.83 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1818  peptide ABC transporter permease protein SapC  49.83 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  hitchhiker  0.00000000000104568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1880  peptide ABC transporter permease SapC  49.83 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0611  hitchhiker  0.00207016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1638  peptide ABC transporter permease SapC  49.83 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000313666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 296 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1782  peptide ABC transporter, permease protein SapC  52.23 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.23 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2542  peptide transport system permease  52.23 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.48 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02837  peptide transport protein (ABC superfamily, membrane)  50 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.21 
 
 		 308 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  44.91 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  44.56 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.14 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  44.1 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  44.64 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  45.32 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.26 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.26 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2194  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component SapC  40 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381606  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  47.08 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.48 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  42.66 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.98 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.53 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.57 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  43.68 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0592  peptide ABC transporter, permease  41.67 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.462704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  43.57 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  43.21 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  41.22 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  41.22 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  41.22 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  41.22 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  41.22 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>