More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3826 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0046  dipeptide transporter  87.67 
 
 		 300 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  91.67 
 
 		 300 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3905  dipeptide transporter  86.67 
 
 		 299 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  94 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4096  dipeptide transporter  85 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3989  dipeptide transporter  91.33 
 
 		 298 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  87 
 
 		 300 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  87.33 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  87.33 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4073  dipeptide transporter  87.33 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0051  dipeptide transporter  86 
 
 		 300 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.644242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  73.01 
 
 		 304 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  64.33 
 
 		 300 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.33 
 
 		 300 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  66.21 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.44 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.73 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.38 
 
 		 300 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.56 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.79 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  65.25 
 
 		 302 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.84 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.79 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.79 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.55 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.85 
 
 		 296 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  64.44 
 
 		 303 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.59 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.32 
 
 		 303 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.46 
 
 		 302 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  63.73 
 
 		 303 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  62.32 
 
 		 303 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.02 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  63.83 
 
 		 293 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  63.93 
 
 		 303 aa  354  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.89 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.38 
 
 		 296 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 		 305 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 		 305 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  58.72 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.62 
 
 		 305 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.39 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0222  dipeptide transport system permease protein  57.53 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.99 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.95 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  61.35 
 
 		 305 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  54.49 
 
 		 301 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0245  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  57.28 
 
 		 313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0258  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  57.28 
 
 		 313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0439  dipeptide transport system permease protein  57.28 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.760641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12500  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  58.92 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0323482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.36 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.25 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  48.81 
 
 		 317 aa  261  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.16 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  48.2 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  48.2 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  48.2 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  48.2 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  48.2 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  44.82 
 
 		 300 aa  254  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.82 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.55 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.55 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757763  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 867 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.73 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>