More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0392 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
296 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.28 
 
 
296 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  72.33 
 
 
300 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.33 
 
 
300 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  75.27 
 
 
300 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.33 
 
 
300 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.22 
 
 
302 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.35 
 
 
311 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.53 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  71.38 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  68.31 
 
 
304 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.47 
 
 
304 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  70.83 
 
 
293 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.47 
 
 
325 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.07 
 
 
302 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.02 
 
 
303 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  66.07 
 
 
303 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.64 
 
 
308 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.94 
 
 
300 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.59 
 
 
308 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3905  dipeptide transporter  65.89 
 
 
299 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.96 
 
 
303 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  64.34 
 
 
303 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0046  dipeptide transporter  68.31 
 
 
300 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.99 
 
 
308 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4096  dipeptide transporter  65.65 
 
 
300 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.29 
 
 
308 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.29 
 
 
308 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  63.64 
 
 
303 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  63.29 
 
 
303 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.94 
 
 
303 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.41 
 
 
305 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.9 
 
 
305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.22 
 
 
305 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.07 
 
 
303 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.72 
 
 
305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.72 
 
 
305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.72 
 
 
305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  61.22 
 
 
305 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  65.33 
 
 
300 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  66.9 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  66.9 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  66.9 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  66.9 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  66.9 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0222  dipeptide transport system permease protein  63.89 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.07 
 
 
305 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.72 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4073  dipeptide transporter  68.31 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  68.31 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  68.31 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  67.61 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0051  dipeptide transporter  67.25 
 
 
300 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.644242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  62.72 
 
 
305 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472877  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0439  dipeptide transport system permease protein  62.59 
 
 
305 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.760641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3989  dipeptide transporter  65.49 
 
 
298 aa  331  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0245  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  62.59 
 
 
313 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0258  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  62.59 
 
 
313 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  56.66 
 
 
301 aa  329  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12500  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  60.75 
 
 
299 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0323482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.65 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.81 
 
 
304 aa  281  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
304 aa  281  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  49.49 
 
 
317 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 
299 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.03 
 
 
303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
312 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  45.58 
 
 
299 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  45.58 
 
 
299 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  45.58 
 
 
299 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  45.58 
 
 
299 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  45.58 
 
 
299 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
305 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
867 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
319 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 
310 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.7 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
294 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.81 
 
 
298 aa  252  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
300 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
300 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
296 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757763  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  46.79 
 
 
300 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.39 
 
 
310 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
285 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.34 
 
 
359 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>