More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0245 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0245  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0258  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0439  dipeptide transport system permease protein  100 
 
 		 305 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.760641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.77 
 
 		 305 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.77 
 
 		 305 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.77 
 
 		 305 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.79 
 
 		 305 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0222  dipeptide transport system permease protein  97.38 
 
 		 305 aa  527  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.77 
 
 		 305 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.44 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.21 
 
 		 305 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  93.11 
 
 		 305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  87.54 
 
 		 305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.25 
 
 		 305 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2971  dipeptide transport system permease protein  99.52 
 
 		 241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.698142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2119  dipeptide transport system permease protein dppC  99.52 
 
 		 241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.2 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.26 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.15 
 
 		 300 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.23 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.91 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  69.26 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.9 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.61 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  67.11 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  66.45 
 
 		 303 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  66.67 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  63.25 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  64.09 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.53 
 
 		 302 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.93 
 
 		 296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.46 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.19 
 
 		 304 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  58.86 
 
 		 302 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.35 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.54 
 
 		 296 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  60.36 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  58.19 
 
 		 293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.99 
 
 		 302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12500  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  67.61 
 
 		 299 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0323482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.54 
 
 		 311 aa  332  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 		 302 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4096  dipeptide transporter  57 
 
 		 300 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0046  dipeptide transporter  59.57 
 
 		 300 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.64 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3905  dipeptide transporter  58.19 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 		 303 aa  318  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.28 
 
 		 303 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  59.57 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  55.16 
 
 		 301 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  57.28 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  57.28 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  57.28 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  57.28 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  57.28 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  57.86 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0051  dipeptide transporter  59.93 
 
 		 300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.644242  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  56.67 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4073  dipeptide transporter  56.67 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  56.67 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.33 
 
 		 303 aa  299  5e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  59.22 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.82 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3989  dipeptide transporter  57.45 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 		 287 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.9 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  48.62 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  43.01 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  43.01 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  43.01 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  43.01 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  43.01 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  46.07 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.65 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.63 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  45.27 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.98941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>