More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0592 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0592  peptide ABC transporter, permease  100 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.462704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2333  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 		 296 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.368345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1933  peptide ABC transporter, permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0171727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01269  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  45.14 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1499  peptide ABC transporter, permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1528  peptide ABC transporter, permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01280  hypothetical protein  45.14 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1830  peptide ABC transporter, permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510881 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1406  peptide ABC transporter, permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1823  peptide transport system permease SapC  45.14 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1456  peptide ABC transporter, permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1880  peptide ABC transporter permease SapC  45.14 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0611  hitchhiker  0.00207016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1818  peptide ABC transporter permease protein SapC  45.14 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  hitchhiker  0.00000000000104568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1638  peptide ABC transporter permease SapC  44.79 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000313666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1782  peptide ABC transporter, permease protein SapC  44.98 
 
 		 296 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 		 296 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2542  peptide transport system permease  44.98 
 
 		 296 aa  252  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0477  peptide transport system permease protein SapC  44.76 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1287  peptide ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.162535  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.381943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1233  peptide ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01868  hypothetical protein  41.26 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1803  peptide ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2582  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757763  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003818  peptide transport system permease protein SapC  40.56 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2194  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component SapC  41.03 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381606  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02837  peptide transport protein (ABC superfamily, membrane)  42.86 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  35.61 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  36.36 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.68 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  37.37 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  37.01 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  37.73 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.46 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.27 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  36.82 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  36.46 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  36.46 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  36.46 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  36.46 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  36.46 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  35.19 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4096  dipeptide transporter  33.94 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0046  dipeptide transporter  34.3 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3905  dipeptide transporter  34.66 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  34.78 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3989  dipeptide transporter  34.3 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  33.94 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  33.94 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>