More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2333 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01269  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  99.66 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.66 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1406  peptide ABC transporter, permease protein SapC  99.66 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.319126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1830  peptide ABC transporter, permease protein SapC  99.66 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1933  peptide ABC transporter, permease protein SapC  99.32 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0171727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2333  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.368345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1528  peptide ABC transporter, permease protein SapC  99.66 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1499  peptide ABC transporter, permease protein SapC  99.66 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01280  hypothetical protein  99.66 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1823  peptide transport system permease SapC  94.26 
 
 		 296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1818  peptide ABC transporter permease protein SapC  94.26 
 
 		 296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  hitchhiker  0.00000000000104568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1880  peptide ABC transporter permease SapC  94.26 
 
 		 296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0611  hitchhiker  0.00207016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1456  peptide ABC transporter, permease protein SapC  94.26 
 
 		 296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1638  peptide ABC transporter permease SapC  93.92 
 
 		 296 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000313666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.85 
 
 		 296 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.99 
 
 		 296 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.31 
 
 		 296 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.03 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1782  peptide ABC transporter, permease protein SapC  76.69 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.69 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2542  peptide transport system permease  76.69 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.24 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.26 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1287  peptide ABC transporter, permease protein  54.39 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0477  peptide transport system permease protein SapC  53.54 
 
 		 295 aa  312  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01868  hypothetical protein  51.35 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003818  peptide transport system permease protein SapC  51.69 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2582  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1233  peptide ABC transporter, permease protein  49.83 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.162535  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.45 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757763  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.381943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1803  peptide ABC transporter, permease protein  50.17 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.42 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0592  peptide ABC transporter, permease  45.49 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.462704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2194  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component SapC  39.06 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381606  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02837  peptide transport protein (ABC superfamily, membrane)  46.46 
 
 		 263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  42.5 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  43.66 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.22 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  42.25 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  42.65 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  42.65 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  43.84 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.13 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.64 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  44.71 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  40.28 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  41.32 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4073  dipeptide transporter  40.42 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  40.42 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  40.42 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  41.26 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  40.28 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>