More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2342 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  45.08 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  48.95 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  45.87 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  45.19 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  45.37 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  45.04 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  39.48 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  42.54 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  38.08 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  43.2 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  38.49 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  40.76 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  44.34 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  42.66 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  42.33 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  42.33 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  39.04 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  41.08 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  37.7 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  40.08 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  37.07 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  41.74 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  39.17 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  37.07 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  37.55 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  41.51 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  41.47 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  35.83 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  38.07 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  38.87 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  36.76 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  37.7 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  41.36 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  36.4 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  39.91 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  35.25 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  37.89 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  36.67 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  37.45 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  37.73 
 
 		 261 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  37.66 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  41.83 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  41.1 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  41.1 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  39.83 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  39.61 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  36.88 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  39.09 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  34.94 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  34.94 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  35.74 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  35.63 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.63 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  39.9 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  35.54 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  35.12 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  38.73 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.69 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  35 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  37.29 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  35.44 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  34.73 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  37.15 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  37.91 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  34.71 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  35.32 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  34.71 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  36.57 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  37.75 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  36.07 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  35.8 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  33.06 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  35.25 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  38.37 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  32.64 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  37.33 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  33.47 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.2 
 
 		 370 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  35.48 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  39.82 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  35.32 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  32.64 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  32.64 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  32.38 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  32.64 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  32.92 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  34.4 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  33.2 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  38.12 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.49 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  35.07 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  36.79 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>