More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0480 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  88.64 
 
 		 264 aa  450  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  84.47 
 
 		 264 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  83.07 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  83.65 
 
 		 264 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  85.04 
 
 		 264 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  84.65 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  37.14 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  37.21 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.3 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.4 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  33.78 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.06 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.18 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  32.13 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.55 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.22 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  36.12 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.82 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.91 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  33.02 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.8 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.92 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.05 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  33.61 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  36.77 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.68 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  33.59 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  36.68 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.35 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  34.71 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  32.34 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.17 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.17 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  33.49 
 
 		 265 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  36.13 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  32.56 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  32.57 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  30.38 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  32.9 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  31.51 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  34.29 
 
 		 413 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  32.46 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  32.9 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  30.9 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  33.62 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  33.05 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.71 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  32.03 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  32.03 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  32.03 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  33.49 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  32.76 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  36.28 
 
 		 430 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  30.9 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  32.76 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.48 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.76 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  31.8 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  31.8 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  31.43 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  32.84 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  31.8 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  31.8 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  31.4 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.56 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  33.18 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.3 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  30.17 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  32.02 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  30.57 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  32.02 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  34.29 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  29.66 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  32.02 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  29.57 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  29.79 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  31.48 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  34.1 
 
 		 406 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  31.65 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>