More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0924 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 256 aa  507  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  86.4 
 
 		 253 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  75.39 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  67.97 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  72.65 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  40.86 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  46.4 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  39.13 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  38.72 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  38.87 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  45.05 
 
 		 249 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  38.49 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  38.49 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  38.1 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  38.84 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  39.26 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  39.09 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  38 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  39.21 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  36.55 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  39.34 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  39.91 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  41.18 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  41.18 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  40.18 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  41.59 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  38.1 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  42.38 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39.07 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  36.84 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  41.44 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  37.89 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  40.19 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  38.75 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  37.89 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.93 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36.05 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  39.38 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  38.33 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  35.59 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  35.08 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  35.66 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  38.66 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  35.27 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  36.65 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  39.06 
 
 		 388 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  39.74 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  37.28 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  37.28 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.2 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  36 
 
 		 265 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  37.6 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  39.05 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  39.9 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  38.1 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  38.18 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  40.29 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  35.84 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  36.63 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  38.53 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  34.53 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  33.99 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  35.29 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  38.17 
 
 		 328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  39.52 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  37.12 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  34.62 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  37.39 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  36.32 
 
 		 375 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.75 
 
 		 386 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  40.19 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  35.43 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  39.19 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  39.46 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  36.32 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  35 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  34.57 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.38 
 
 		 374 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  36.32 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  38.18 
 
 		 374 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  38.18 
 
 		 374 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  36.77 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  34.55 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  35.2 
 
 		 376 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  37.44 
 
 		 374 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  37.44 
 
 		 447 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  38.03 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  36.24 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>