More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4314 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  62.24 
 
 
245 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  50.2 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  51.5 
 
 
269 aa  258  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  47.46 
 
 
271 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  49.38 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  50.46 
 
 
262 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  45.49 
 
 
269 aa  234  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  40.77 
 
 
260 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  40.33 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  40.69 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  38.46 
 
 
264 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  38.24 
 
 
257 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  38.66 
 
 
257 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  38.75 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  40.17 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.39 
 
 
270 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  39.39 
 
 
256 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  38.26 
 
 
260 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  35.86 
 
 
264 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  39.67 
 
 
256 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  36.48 
 
 
263 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  36.48 
 
 
263 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  35.32 
 
 
260 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
251 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  39.15 
 
 
266 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  36.6 
 
 
260 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  38.53 
 
 
268 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  39.19 
 
 
257 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.68 
 
 
257 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35.34 
 
 
251 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35.34 
 
 
251 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  36.4 
 
 
267 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  36.73 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  37.33 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  35.39 
 
 
260 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  39.66 
 
 
257 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  36.51 
 
 
267 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.68 
 
 
255 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  37 
 
 
248 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  37.02 
 
 
266 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36 
 
 
270 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  39.5 
 
 
258 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  35 
 
 
250 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  37.28 
 
 
246 aa  149  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.89 
 
 
383 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  39.35 
 
 
260 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  35.06 
 
 
260 aa  148  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  40.09 
 
 
260 aa  148  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  40.09 
 
 
260 aa  148  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  38.25 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.98 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  38.24 
 
 
269 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.23 
 
 
258 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  36.4 
 
 
249 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  37.1 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 
258 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  30.52 
 
 
258 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  35.29 
 
 
258 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  40.39 
 
 
263 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  34.35 
 
 
376 aa  142  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  36.99 
 
 
259 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  38.64 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  33.62 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  36.21 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  39.19 
 
 
247 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  33.64 
 
 
261 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  37.32 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  33.73 
 
 
260 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  32.66 
 
 
260 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  32.92 
 
 
386 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  34.65 
 
 
258 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  35.51 
 
 
258 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  35.93 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  33.76 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  36.62 
 
 
255 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  36.32 
 
 
261 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  35.34 
 
 
262 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  36.13 
 
 
267 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  34.18 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  38.25 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  33.17 
 
 
382 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  33.77 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  35.89 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  34.55 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  36.28 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  31.53 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  33.73 
 
 
258 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  30.9 
 
 
393 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  35.16 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  33.73 
 
 
258 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  30.32 
 
 
369 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.9 
 
 
377 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  34.92 
 
 
260 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  34.92 
 
 
260 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  35.07 
 
 
261 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  34.92 
 
 
260 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>