More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0741 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
267 aa  524  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  72.84 
 
 
267 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  68.9 
 
 
267 aa  361  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  66.15 
 
 
270 aa  352  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  54.33 
 
 
263 aa  274  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  52.92 
 
 
256 aa  261  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  50.77 
 
 
261 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  51.15 
 
 
256 aa  254  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  50.78 
 
 
257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  47.49 
 
 
269 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  50.58 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  52.14 
 
 
258 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  44.36 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  43.13 
 
 
263 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  42.08 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  41.9 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  40.31 
 
 
260 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  40.31 
 
 
260 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  43.92 
 
 
264 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  41.73 
 
 
260 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  44.26 
 
 
255 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  45.95 
 
 
255 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  43.69 
 
 
265 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  45.95 
 
 
255 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  43.24 
 
 
255 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  43.69 
 
 
255 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  43.69 
 
 
255 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  43.24 
 
 
255 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  38.43 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  38.37 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  40.47 
 
 
262 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  42.79 
 
 
255 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  43.69 
 
 
262 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
255 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  43.69 
 
 
255 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  39.69 
 
 
265 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  43.78 
 
 
259 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  44.24 
 
 
260 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  42.34 
 
 
255 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  40.53 
 
 
259 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  41.63 
 
 
260 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  41.57 
 
 
260 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  43.36 
 
 
234 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  38.85 
 
 
258 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  42.22 
 
 
259 aa  185  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  43.64 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  40.47 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  38.91 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  38.02 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  40.08 
 
 
263 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  38.52 
 
 
265 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  182  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  38.43 
 
 
261 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  42.86 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  38.52 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  39.37 
 
 
258 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  38.98 
 
 
261 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  38.52 
 
 
265 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  40.94 
 
 
260 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  37.4 
 
 
265 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  40.82 
 
 
261 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  38.98 
 
 
261 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  38.98 
 
 
261 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  43.11 
 
 
261 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  43.11 
 
 
261 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  39.33 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  42.22 
 
 
261 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  42.22 
 
 
261 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  41.96 
 
 
260 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  38.93 
 
 
265 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  42.22 
 
 
261 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  42.22 
 
 
261 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  42.41 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  37.88 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  40.31 
 
 
260 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  41.28 
 
 
260 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  40.31 
 
 
260 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  40.31 
 
 
260 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  39.77 
 
 
261 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  38.76 
 
 
263 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  37.36 
 
 
265 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  37.74 
 
 
265 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  38.19 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  36.96 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  39.15 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  37.35 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0686  hypothetical protein  39.92 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  40.41 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  37.84 
 
 
258 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  39.3 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  41.01 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  41.01 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  43.46 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  37.31 
 
 
263 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2936  hypothetical protein  42.04 
 
 
260 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  42.04 
 
 
260 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>