More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0797 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  70.28 
 
 
271 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  70.56 
 
 
262 aa  332  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  61.74 
 
 
264 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  62.81 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  51.5 
 
 
252 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  48.52 
 
 
245 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  42.36 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  33.21 
 
 
264 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.94 
 
 
260 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  37.27 
 
 
257 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  37.07 
 
 
260 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  35.68 
 
 
257 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  38.57 
 
 
260 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
260 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  37.05 
 
 
257 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  35.98 
 
 
256 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  35.34 
 
 
260 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.45 
 
 
270 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  35.06 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  41.15 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.62 
 
 
260 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.14 
 
 
266 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  35.06 
 
 
275 aa  143  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  32.8 
 
 
267 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  35.71 
 
 
267 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  38.03 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  38.03 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  37 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  38.34 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  32.94 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  37.14 
 
 
263 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  35.91 
 
 
260 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  35.85 
 
 
256 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  33.07 
 
 
267 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  35.38 
 
 
258 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  34.43 
 
 
261 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  37.98 
 
 
248 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  35.81 
 
 
268 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  37.75 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  33.79 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  35.05 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  37.75 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.19 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35.81 
 
 
251 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35.81 
 
 
251 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  32.07 
 
 
383 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  31.37 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.2 
 
 
270 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  33.03 
 
 
372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.08 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  32.39 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  35.55 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  31.56 
 
 
382 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.42 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  31.25 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  31.58 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  31.44 
 
 
375 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  33.99 
 
 
253 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  31.82 
 
 
364 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  36.32 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  36.54 
 
 
265 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  33.49 
 
 
266 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  28.35 
 
 
383 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  30.63 
 
 
258 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  32.23 
 
 
365 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.21 
 
 
328 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.49 
 
 
250 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.5 
 
 
384 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  30.24 
 
 
380 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  30.92 
 
 
250 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  36.09 
 
 
257 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  34.01 
 
 
260 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  32.58 
 
 
285 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  29.36 
 
 
382 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  28.12 
 
 
376 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  32.38 
 
 
384 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  34.31 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  32.04 
 
 
413 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  28.19 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  29.52 
 
 
376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  28.19 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.97 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  33.5 
 
 
249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  35.61 
 
 
253 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  32.76 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.1 
 
 
376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.12 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  33.49 
 
 
258 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  34.16 
 
 
260 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  30.14 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  32.87 
 
 
366 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  32.87 
 
 
366 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  32.87 
 
 
250 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>