More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2870 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  501  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  62.11 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  67.31 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  57.42 
 
 
257 aa  295  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  58.66 
 
 
260 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  57.09 
 
 
260 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  57.09 
 
 
260 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  56.69 
 
 
270 aa  281  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  57.87 
 
 
260 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  55.73 
 
 
258 aa  266  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  52.12 
 
 
260 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  54.12 
 
 
268 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  50.97 
 
 
264 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  50.84 
 
 
256 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  44.27 
 
 
265 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  49 
 
 
256 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  39.44 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  43.48 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  46.18 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  46.34 
 
 
261 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  51.76 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  46.22 
 
 
258 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  46.3 
 
 
257 aa  198  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  47.53 
 
 
257 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  46.86 
 
 
269 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  44.03 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  40.87 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  42.34 
 
 
258 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  39.25 
 
 
263 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  42.04 
 
 
250 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  40.31 
 
 
267 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  43.11 
 
 
263 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  43.11 
 
 
263 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  41.57 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39.68 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  38.76 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  41.78 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  38.49 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  38.76 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  38.49 
 
 
258 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  43.11 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  39.45 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  43.64 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  38.52 
 
 
260 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  38.52 
 
 
260 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  46.31 
 
 
260 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  38.91 
 
 
265 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  38.52 
 
 
266 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  38.52 
 
 
265 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  38.22 
 
 
260 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
250 aa  175  6e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  38.52 
 
 
265 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  36.96 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  42.62 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  37.89 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  41.2 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  37.5 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  40.44 
 
 
380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  36.58 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  44.09 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  39.83 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.83 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  36.33 
 
 
265 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  37.84 
 
 
260 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  39.39 
 
 
251 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  38.43 
 
 
266 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  43.96 
 
 
250 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  39.44 
 
 
265 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  37.7 
 
 
268 aa  168  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  42.99 
 
 
264 aa  168  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  37.4 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  36.6 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  40.57 
 
 
266 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  39.57 
 
 
265 aa  164  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  37.3 
 
 
266 aa  165  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  35.94 
 
 
269 aa  164  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  36.43 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  39.38 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  36.29 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  41.32 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  39.38 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  37.88 
 
 
261 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  42.13 
 
 
248 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  35.69 
 
 
261 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  38.78 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  37.79 
 
 
263 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  40.89 
 
 
265 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  38.5 
 
 
255 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  38.5 
 
 
255 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  36.6 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  37.93 
 
 
261 aa  161  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  35.63 
 
 
259 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  37.97 
 
 
260 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
255 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  42.53 
 
 
257 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  38.5 
 
 
255 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  37.79 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  37.79 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  42.48 
 
 
256 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  38.5 
 
 
255 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>