More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0966 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  520  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  99.25 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  98.87 
 
 		 265 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  99.62 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  88.3 
 
 		 265 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  88.3 
 
 		 265 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  86.04 
 
 		 265 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  85.66 
 
 		 265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  84.91 
 
 		 265 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  87.17 
 
 		 265 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  81.06 
 
 		 265 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  73.08 
 
 		 260 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  66.15 
 
 		 260 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  66.8 
 
 		 258 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  66.8 
 
 		 260 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  66.8 
 
 		 260 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  66.8 
 
 		 260 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  67.46 
 
 		 258 aa  334  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  67.73 
 
 		 259 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  65.9 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  66.02 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  66.41 
 
 		 260 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  66.02 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  66.02 
 
 		 260 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  62.88 
 
 		 264 aa  331  6e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  66.14 
 
 		 261 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  65.64 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  63.6 
 
 		 263 aa  326  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  66 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  62.55 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  62.16 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  62.55 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  62.55 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  62.55 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  62.55 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  63.71 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  62.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  61.92 
 
 		 261 aa  317  9e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  62.55 
 
 		 261 aa  315  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  63.32 
 
 		 260 aa  314  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  62.93 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  62.69 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  64.23 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  59.07 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  62.55 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  62.55 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  62.55 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  58.94 
 
 		 265 aa  311  9e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  61.78 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  61.78 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  61.78 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  61.78 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  60.62 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  60.62 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  63.35 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  60.32 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  58.91 
 
 		 260 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  58.91 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  61.51 
 
 		 260 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  59.52 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  56.37 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  56.81 
 
 		 262 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  58 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  58 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  56.35 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  64.52 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  63.59 
 
 		 255 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  63.59 
 
 		 255 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  63.13 
 
 		 255 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  60.55 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  62.67 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  62.67 
 
 		 255 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  62.67 
 
 		 255 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  62.67 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  61.01 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  54.94 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  56.65 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  61.75 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  61.75 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  53.88 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  53.88 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  55.17 
 
 		 266 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  60.83 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  59.2 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>