More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1694 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  52.81 
 
 
246 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  54.59 
 
 
256 aa  238  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  45.87 
 
 
256 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  45.42 
 
 
261 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  44.58 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  45.53 
 
 
267 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  43.9 
 
 
269 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  44.08 
 
 
250 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  46.15 
 
 
267 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  44.08 
 
 
270 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  40.82 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  38.62 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  42.17 
 
 
263 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  41.88 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  41.41 
 
 
257 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  41.2 
 
 
260 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  40.08 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  43.98 
 
 
257 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  39.56 
 
 
258 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  45.05 
 
 
251 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  45.05 
 
 
251 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  45.05 
 
 
251 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  40.08 
 
 
260 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  43.95 
 
 
258 aa  175  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  40.08 
 
 
260 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  41.13 
 
 
267 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  39.35 
 
 
263 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  42.26 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  39.24 
 
 
260 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  40.08 
 
 
262 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  40.99 
 
 
260 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  41.04 
 
 
249 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  40.17 
 
 
328 aa  168  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  42.49 
 
 
260 aa  168  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
260 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  40.28 
 
 
263 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  40.74 
 
 
260 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  40.28 
 
 
263 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  37.55 
 
 
264 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  40.74 
 
 
260 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.11 
 
 
266 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  37.6 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  40.91 
 
 
264 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  36.73 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  37.34 
 
 
260 aa  165  8e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  38.84 
 
 
261 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  40.87 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  37.65 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  38.84 
 
 
255 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  38.11 
 
 
255 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  38.11 
 
 
255 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  38.05 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  38.11 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  39.81 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.42 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  37.61 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  44.23 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  38.52 
 
 
260 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  38.72 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  40.25 
 
 
258 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  37.18 
 
 
255 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 
258 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  40.28 
 
 
265 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  37.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  37.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  37.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  37.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  39.91 
 
 
260 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  37.25 
 
 
263 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  37.17 
 
 
261 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  37.44 
 
 
255 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  35.22 
 
 
258 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  37.55 
 
 
261 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  37.17 
 
 
261 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  37.17 
 
 
261 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  37.17 
 
 
261 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  37.79 
 
 
266 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  36.78 
 
 
262 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  39.01 
 
 
260 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  38.65 
 
 
261 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  36.78 
 
 
260 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  39.62 
 
 
264 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  37.95 
 
 
265 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  36.71 
 
 
260 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  34.94 
 
 
258 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  37.3 
 
 
263 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  34.34 
 
 
265 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  37.08 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  38.39 
 
 
259 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  34.85 
 
 
258 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  36.92 
 
 
265 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  37.08 
 
 
265 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  38.14 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  38.14 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>