More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2892 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  99.61 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  90.98 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  79.22 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  78.82 
 
 		 255 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  79.22 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  78.82 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  78.82 
 
 		 255 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  78.82 
 
 		 255 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  78.04 
 
 		 255 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  78.82 
 
 		 255 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  78.26 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  76.49 
 
 		 262 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  76.89 
 
 		 265 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  75.89 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  79.22 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  72.73 
 
 		 260 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  72.94 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  73.91 
 
 		 260 aa  348  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  71.94 
 
 		 260 aa  343  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  77.25 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  70.87 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  70.36 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  70.36 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  76.47 
 
 		 255 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  71.94 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  68.77 
 
 		 262 aa  328  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  70.47 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  65.22 
 
 		 265 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  64.82 
 
 		 263 aa  316  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2936  hypothetical protein  69.14 
 
 		 260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0686  hypothetical protein  66.67 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  61.81 
 
 		 263 aa  301  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  62.4 
 
 		 262 aa  298  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  64.4 
 
 		 260 aa  295  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  61.18 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  61.66 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  61.26 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  68.61 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  61.66 
 
 		 260 aa  288  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  58.5 
 
 		 259 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  58.5 
 
 		 261 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  59.6 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  60.08 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  58.5 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  61.66 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  63.32 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  58.69 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  60.87 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  59.68 
 
 		 260 aa  281  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  59.29 
 
 		 260 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  59.14 
 
 		 260 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  63.93 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  56.98 
 
 		 260 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  58.89 
 
 		 263 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  60 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  58.3 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  58.1 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  58.1 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  57.31 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  58.1 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  59.68 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  58.1 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  58.5 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  59.29 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  57.71 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  60.7 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  60.47 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  60.4 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  65.9 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  57.71 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  61.47 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  61.47 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  60.74 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  60.74 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  60.74 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  60.74 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  60.74 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  56.4 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  63.08 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  60.74 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  62.21 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  57.31 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  57.31 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  57.31 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  57.31 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>