More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3181 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  81.25 
 
 
256 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  76.56 
 
 
256 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  74.61 
 
 
257 aa  377  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  75.78 
 
 
257 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  62.31 
 
 
269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  62.26 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  57.25 
 
 
267 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  54.41 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  50.2 
 
 
256 aa  265  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  55.74 
 
 
267 aa  265  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  50.77 
 
 
267 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  53.15 
 
 
263 aa  248  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  53.23 
 
 
258 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  45.56 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  45.28 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  45.28 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  48.24 
 
 
255 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  48.24 
 
 
255 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  45.28 
 
 
258 aa  232  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  48.24 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  48.24 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  48.24 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  47.84 
 
 
255 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  47.84 
 
 
255 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  45.7 
 
 
259 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  44.96 
 
 
265 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  46.51 
 
 
259 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  46.8 
 
 
261 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  44.96 
 
 
265 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  43.85 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  45.91 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  47.22 
 
 
255 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  44.18 
 
 
263 aa  224  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  46.9 
 
 
258 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  46.67 
 
 
262 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  46.83 
 
 
255 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  46 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  45.14 
 
 
261 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  47.66 
 
 
260 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  46.43 
 
 
255 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  45.49 
 
 
261 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  45.35 
 
 
261 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  46.51 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  45.95 
 
 
263 aa  221  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  46.12 
 
 
258 aa  221  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  44.57 
 
 
261 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  44.57 
 
 
261 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  44.57 
 
 
261 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  44.57 
 
 
261 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  49.32 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  46.83 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  49.54 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  44.96 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  45.14 
 
 
260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  46.4 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  46.4 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  46.4 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  47.83 
 
 
265 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  45.35 
 
 
260 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  45.35 
 
 
260 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  44.05 
 
 
264 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  45.35 
 
 
260 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  46.12 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  47.04 
 
 
265 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  46.51 
 
 
261 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  47.04 
 
 
265 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  44.98 
 
 
260 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  44.96 
 
 
263 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  46.12 
 
 
260 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  43.8 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  44.53 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  48.17 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  50.47 
 
 
260 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  46.25 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  48.13 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  43.8 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  45.85 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  43.08 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  43.08 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  47.71 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  43.94 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  43.36 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  44.44 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  46.03 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  43.3 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
260 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  43.56 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  46.67 
 
 
260 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  46.67 
 
 
260 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  46.03 
 
 
260 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>