More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2961 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  90.98 
 
 		 255 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  90.98 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  77.25 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  77.47 
 
 		 258 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  77.25 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  74.51 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  77.65 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  77.08 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  77.65 
 
 		 255 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  77.65 
 
 		 255 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  74.12 
 
 		 262 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  76.47 
 
 		 255 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  77.25 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  77.25 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  74.31 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  74.12 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  77.65 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  72.44 
 
 		 259 aa  349  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  71.54 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  71.94 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  72.66 
 
 		 260 aa  342  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  77.25 
 
 		 255 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  68.77 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  76.08 
 
 		 255 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  68.77 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  71.25 
 
 		 262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  70.87 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0686  hypothetical protein  65.22 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  65.75 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2936  hypothetical protein  66.4 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  62.85 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  62.81 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  62.81 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  64.17 
 
 		 258 aa  294  7e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  68.95 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  61.16 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  66.96 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  64.17 
 
 		 259 aa  289  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  66.52 
 
 		 260 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  61.73 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  61.09 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  61.81 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  57.71 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  60.49 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  59.11 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  63.91 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  64.35 
 
 		 260 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  61.92 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  62.72 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  62.17 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  65.28 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  58.5 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  62.55 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  59.68 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  62.61 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  62.61 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  62.61 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  59.5 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  57.25 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  60.24 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  58.1 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  61.84 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  61.16 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  61.16 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  61.16 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  61.16 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  60.89 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  61.16 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  61.84 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  62.03 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  65.44 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  61.16 
 
 		 260 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  65.44 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  63.01 
 
 		 266 aa  275  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  56.2 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  60.99 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  57.81 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  63.64 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>